我国部分地区H9亚型禽流感病毒血凝素基因序列比较与遗传发生关系分析

被引:37
作者
刘红旗
程坚
彭大新
贾立军
张如宽
刘秀梵
机构
[1] 扬州大学农业部畜禽传染病学重点开放实验室
[2] 扬州大学农业部畜禽传染病学重点开放实验室 扬州
关键词
H9亚型禽流感; 同源性; 序列分析; 遗传发生关系;
D O I
10.13343/j.cnki.wsxb.2002.03.005
中图分类号
S852.65 [家畜病毒学];
学科分类号
090601 ;
摘要
为从分子水平掌握我国H9亚型AIV的遗传变异情况和流行规律 ,本研究汇集近年来从我国 1 2个省、市、自治区的发病鸡群中分离到的 2 3株H9亚型禽流感病毒 ,通过RT -PCR方法和核苷酸序列测定获得了 2 3个毒株的HA基因cDNA核苷酸序列。核苷酸和推导的氨基酸序列同源性比较结果表明 ,这些毒株HA基因的核苷酸序列同源性为 94.1 %~1 0 0 % ,氨基酸序列同源性为 95 .4%~ 1 0 0 % ;将这 2 3个毒株和来自亚洲及世界其它地区的另外 3 1株的HA基因cDNA序列同源性进行比较发现 ,分离自香港的HK1 70 4 99株与日本的 2个毒株关系较近 ;氨基酸序列分析发现 ,CKGS1 99、CKTJ1 96、CKTJ2 96、CKSH3 0 0和CKBJ1 97五个毒株各发生了一个潜在的糖基化位点的丢失。 5 4株H9亚型AIVHA基因 5 5bp~ 1 1 5 2bp的氨基酸序列分析发现 ,裂解位点尽管有 1 0种基序 ,但本研究中的 2 3株和近年来从我国大陆和香港地区的分离的毒株则均为RSSR↓GLF ;构成受体结合位点的 1 91位氨基酸有一个规律 ,即所有中国大陆毒株与部分香港毒株都为N ,其它毒株均为H ,1 41aa~ 1 43aa处的糖基化位点有与 1 91aa类似的规律 ,即 :凡是 1 91aa为N的毒株 ,该处均为NVS(CKBJ1 94除外 ) ,凡是1 91aa为H的毒株 ,则该处均为NVT ;遗传发生关系分析 ,中国大陆
引用
收藏
页码:288 / 297
页数:10
相关论文
共 3 条
[1]   禽流感临诊症状及病理变化综述 [J].
陈伯伦 ;
张泽纪 ;
陈伟斌 .
养禽与禽病防治, 2000, (07) :11-13
[2]   禽流感研究I.鸡A型禽流感病毒的分离与血清学初步鉴定 [J].
陈伯伦,张泽纪,陈伟斌 .
中国兽医杂志, 1994, (10) :3-5
[3]  
禽流感[M]. 北京农业大学出版社 , 甘孟侯主编, 1995