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基于28S rDNA部分序列的石磺科系统发育研究
被引:20
作者
:
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陈诚
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机构:
沈和定
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机构:
吴文健
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机构:
魏峦峦
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机构:
王玲
机构
:
[1]
上海海洋大学水产与生命学院
来源
:
生物技术通报
|
2010年
/ 06期
关键词
:
28S rDNA;
D区;
石磺;
系统发育;
D O I
:
10.13560/j.cnki.biotech.bull.1985.2010.06.041
中图分类号
:
S917.4 [水产动物学];
学科分类号
:
090805
[渔业资源学]
;
摘要
:
采用PCR技术对采集自中国大陆沿海5地8个群体石磺的28S rDNA部分序列进行扩增。将测序结果与Gen-Bank中的另外3条石磺科贝类的对应序列一起,以小鼠28S rDNA基因序列进行参照,截取D1、D2、D3区域,拼接后进行比对分析。在获得的689bp的序列中,有76个变异位点,28个简约信息位点,A+T平均含量为30.9%,C+G平均含量为69.0%。以分类关系较近的菊花螺科(Siphonaria alternate)为外群,用NJ、MP、ML和贝叶斯法构建分子系统树。4种方法得到的进化树拓扑结构很相似,得到的结果也与沈和定提出的中国大陆沿海石磺科贝类可划分为Peronia、Platevindex、Onchidium、Paraoncidium4个属的观点基本一致。同时,28S rDNA部分序列的系统分析还显示,4个属中Peronia属与Paraoncidium属亲缘关系较近,Platevindex属与Onchidium属关系比较近。
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相关论文
共 10 条
[1]
几种饲料对石磺的暂养效果及其消化率的初步研究
[J].
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沈和定
;
陈汉春
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上海水产大学生命科学与技术学院,浙江省慈溪市水产技术推广中心,浙江省慈溪市水产技术推广中心,上海水产大学生命科学与技术学院,上海水产大学生命科学与技术学院,上海水产大学生命科学与技术学院上海 ,浙江慈溪 ,浙江慈溪 ,上海 ,上海 ,上海
陈汉春
;
陈贤龙
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上海水产大学生命科学与技术学院,浙江省慈溪市水产技术推广中心,浙江省慈溪市水产技术推广中心,上海水产大学生命科学与技术学院,上海水产大学生命科学与技术学院,上海水产大学生命科学与技术学院上海 ,浙江慈溪 ,浙江慈溪 ,上海 ,上海 ,上海
陈贤龙
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孙华伟
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上海水产大学生命科学与技术学院,浙江省慈溪市水产技术推广中心,浙江省慈溪市水产技术推广中心,上海水产大学生命科学与技术学院,上海水产大学生命科学与技术学院,上海水产大学生命科学与技术学院上海 ,浙江慈溪 ,浙江慈溪 ,上海 ,上海 ,上海
孙华伟
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华雪铭
;
肖华军
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上海水产大学生命科学与技术学院,浙江省慈溪市水产技术推广中心,浙江省慈溪市水产技术推广中心,上海水产大学生命科学与技术学院,上海水产大学生命科学与技术学院,上海水产大学生命科学与技术学院上海 ,浙江慈溪 ,浙江慈溪 ,上海 ,上海 ,上海
肖华军
.
上海水产大学学报,
2004,
(04)
:293
-297
[2]
石磺的生物学特性及其增养殖前景分析
[J].
论文数:
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机构:
沈和定
;
论文数:
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机构:
李家乐
;
张缓溶
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上海水产大学生命科学与技术学院,上海水产大学生命科学与技术学院,上海水产大学生命科学与技术学院,,
张缓溶
.
中国水产,
2004,
(01)
:60
-63
[3]
分子系统进化关系分析的一种新方法——贝叶斯法在硬蜱属中的应用
[J].
徐广
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南乔治亚大学生物系和美国国家蜱博物馆,南乔治亚大学生物系和美国国家蜱博物馆,南乔治亚大学生物系和美国国家蜱博物馆,南乔治亚大学生物系和美国国家蜱博物馆Statesboro,GA,美国,Statesboro,GA,美国,Statesboro,GA,美国,Statesboro,GA,美国
徐广
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方庆权
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南乔治亚大学生物系和美国国家蜱博物馆,南乔治亚大学生物系和美国国家蜱博物馆,南乔治亚大学生物系和美国国家蜱博物馆,南乔治亚大学生物系和美国国家蜱博物馆Statesboro,GA,美国,Statesboro,GA,美国,Statesboro,GA,美国,Statesboro,GA,美国
方庆权
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James E. KEIRANS
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南乔治亚大学生物系和美国国家蜱博物馆,南乔治亚大学生物系和美国国家蜱博物馆,南乔治亚大学生物系和美国国家蜱博物馆,南乔治亚大学生物系和美国国家蜱博物馆Statesboro,GA,美国,Statesboro,GA,美国,Statesboro,GA,美国,Statesboro,GA,美国
James E. KEIRANS
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Lance A. DURDEN
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南乔治亚大学生物系和美国国家蜱博物馆,南乔治亚大学生物系和美国国家蜱博物馆,南乔治亚大学生物系和美国国家蜱博物馆,南乔治亚大学生物系和美国国家蜱博物馆Statesboro,GA,美国,Statesboro,GA,美国,Statesboro,GA,美国,Statesboro,GA,美国
Lance A. DURDEN
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动物学报,
2003,
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-388
[4]
苏沪沿海瘤背石磺的形态和习性
[J].
邱立言
论文数:
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机构:
盐城教育学院盐城
邱立言
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动物学杂志,
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The phylogenetic characteristics of three different 28S rRNA gene regions in Encarsia (Insecta, Hymenoptera, Aphelinidae)
[J].
Schmidt, Stefan
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Zool Staatssammlung Munchen, D-81247 Munich, Germany
Schmidt, Stefan
;
Driver, Felice
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Zool Staatssammlung Munchen, D-81247 Munich, Germany
Driver, Felice
;
De Barro, Paul
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机构:
Zool Staatssammlung Munchen, D-81247 Munich, Germany
De Barro, Paul
.
ORGANISMS DIVERSITY & EVOLUTION,
2006,
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(02)
:127
-139
[8]
Molecular systematics of basal subfamilies of ants using 28S rRNA (Hymenoptera: Formicidae)
[J].
Ouellette, Gary D.
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机构:
Calif Acad Sci, Dept Entomol, San Francisco, CA 94103 USA
Ouellette, Gary D.
;
Fisher, Brian L.
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机构:
Calif Acad Sci, Dept Entomol, San Francisco, CA 94103 USA
Fisher, Brian L.
;
Girman, Derek J.
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机构:
Calif Acad Sci, Dept Entomol, San Francisco, CA 94103 USA
Girman, Derek J.
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MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION,
2006,
40
(02)
:359
-369
[9]
New clades of euthyneuran gastropods (Mollusca) from 28S rRNA sequences
[J].
Dayrat, B
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机构:
Museum Natl Hist Nat, CNRS, FR 1541, Inst Systemat, F-75005 Paris, France
Dayrat, B
;
Tillier, A
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Museum Natl Hist Nat, CNRS, FR 1541, Inst Systemat, F-75005 Paris, France
Tillier, A
;
Lecointre, G
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Museum Natl Hist Nat, CNRS, FR 1541, Inst Systemat, F-75005 Paris, France
Lecointre, G
;
Tillier, S
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机构:
Museum Natl Hist Nat, CNRS, FR 1541, Inst Systemat, F-75005 Paris, France
Tillier, S
.
MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION,
2001,
19
(02)
:225
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[10]
RIBOSOMAL DNA - MOLECULAR EVOLUTION AND PHYLOGENETIC INFERENCE
[J].
HILLIS, DM
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机构:
Department of Zoology, University of Texas, Austin
HILLIS, DM
;
DIXON, MT
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Department of Zoology, University of Texas, Austin
DIXON, MT
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QUARTERLY REVIEW OF BIOLOGY,
1991,
66
(04)
:411
-453
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共 10 条
[1]
几种饲料对石磺的暂养效果及其消化率的初步研究
[J].
论文数:
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机构:
沈和定
;
陈汉春
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上海水产大学生命科学与技术学院,浙江省慈溪市水产技术推广中心,浙江省慈溪市水产技术推广中心,上海水产大学生命科学与技术学院,上海水产大学生命科学与技术学院,上海水产大学生命科学与技术学院上海 ,浙江慈溪 ,浙江慈溪 ,上海 ,上海 ,上海
陈汉春
;
陈贤龙
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上海水产大学生命科学与技术学院,浙江省慈溪市水产技术推广中心,浙江省慈溪市水产技术推广中心,上海水产大学生命科学与技术学院,上海水产大学生命科学与技术学院,上海水产大学生命科学与技术学院上海 ,浙江慈溪 ,浙江慈溪 ,上海 ,上海 ,上海
陈贤龙
;
孙华伟
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上海水产大学生命科学与技术学院,浙江省慈溪市水产技术推广中心,浙江省慈溪市水产技术推广中心,上海水产大学生命科学与技术学院,上海水产大学生命科学与技术学院,上海水产大学生命科学与技术学院上海 ,浙江慈溪 ,浙江慈溪 ,上海 ,上海 ,上海
孙华伟
;
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华雪铭
;
肖华军
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上海水产大学生命科学与技术学院,浙江省慈溪市水产技术推广中心,浙江省慈溪市水产技术推广中心,上海水产大学生命科学与技术学院,上海水产大学生命科学与技术学院,上海水产大学生命科学与技术学院上海 ,浙江慈溪 ,浙江慈溪 ,上海 ,上海 ,上海
肖华军
.
上海水产大学学报,
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[2]
石磺的生物学特性及其增养殖前景分析
[J].
论文数:
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机构:
沈和定
;
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李家乐
;
张缓溶
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上海水产大学生命科学与技术学院,上海水产大学生命科学与技术学院,上海水产大学生命科学与技术学院,,
张缓溶
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中国水产,
2004,
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分子系统进化关系分析的一种新方法——贝叶斯法在硬蜱属中的应用
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徐广
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南乔治亚大学生物系和美国国家蜱博物馆,南乔治亚大学生物系和美国国家蜱博物馆,南乔治亚大学生物系和美国国家蜱博物馆,南乔治亚大学生物系和美国国家蜱博物馆Statesboro,GA,美国,Statesboro,GA,美国,Statesboro,GA,美国,Statesboro,GA,美国
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方庆权
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James E. KEIRANS
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Lance A. DURDEN
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南乔治亚大学生物系和美国国家蜱博物馆,南乔治亚大学生物系和美国国家蜱博物馆,南乔治亚大学生物系和美国国家蜱博物馆,南乔治亚大学生物系和美国国家蜱博物馆Statesboro,GA,美国,Statesboro,GA,美国,Statesboro,GA,美国,Statesboro,GA,美国
Lance A. DURDEN
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动物学报,
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苏沪沿海瘤背石磺的形态和习性
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邱立言
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Schmidt, Stefan
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机构:
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Schmidt, Stefan
;
Driver, Felice
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Zool Staatssammlung Munchen, D-81247 Munich, Germany
Driver, Felice
;
De Barro, Paul
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机构:
Zool Staatssammlung Munchen, D-81247 Munich, Germany
De Barro, Paul
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2006,
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(02)
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Molecular systematics of basal subfamilies of ants using 28S rRNA (Hymenoptera: Formicidae)
[J].
Ouellette, Gary D.
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机构:
Calif Acad Sci, Dept Entomol, San Francisco, CA 94103 USA
Ouellette, Gary D.
;
Fisher, Brian L.
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Calif Acad Sci, Dept Entomol, San Francisco, CA 94103 USA
Fisher, Brian L.
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Girman, Derek J.
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Calif Acad Sci, Dept Entomol, San Francisco, CA 94103 USA
Girman, Derek J.
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MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION,
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40
(02)
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New clades of euthyneuran gastropods (Mollusca) from 28S rRNA sequences
[J].
Dayrat, B
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机构:
Museum Natl Hist Nat, CNRS, FR 1541, Inst Systemat, F-75005 Paris, France
Dayrat, B
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Tillier, A
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Museum Natl Hist Nat, CNRS, FR 1541, Inst Systemat, F-75005 Paris, France
Tillier, A
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Lecointre, G
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Museum Natl Hist Nat, CNRS, FR 1541, Inst Systemat, F-75005 Paris, France
Lecointre, G
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Tillier, S
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Museum Natl Hist Nat, CNRS, FR 1541, Inst Systemat, F-75005 Paris, France
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.
MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION,
2001,
19
(02)
:225
-235
[10]
RIBOSOMAL DNA - MOLECULAR EVOLUTION AND PHYLOGENETIC INFERENCE
[J].
HILLIS, DM
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机构:
Department of Zoology, University of Texas, Austin
HILLIS, DM
;
DIXON, MT
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机构:
Department of Zoology, University of Texas, Austin
DIXON, MT
.
QUARTERLY REVIEW OF BIOLOGY,
1991,
66
(04)
:411
-453
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