引起深圳市一起疱疹性咽峡炎暴发的柯萨奇A4病毒的鉴定及其VP1区序列分析

被引：6

作者：

蔡春林 ^{[1
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姚相杰 ^{[2
]}

卓菲 ^{[1
]}

何雅青 ^{[2
]}

杨贵清 ^{[1
]}

机构：

[1] 深圳市罗湖区疾病预防控制中心

[2] 深圳市疾病预防控制中心重大传染病监控实验室

来源：

中国卫生检验杂志 | 2015年 / 25卷 / 06期

关键词：

疱疹性咽峡炎; 柯萨奇病毒A组4型; VP1序列分析; 亚型;

D O I：

暂无

中图分类号：

R440 [];

学科分类号：

100208 ;

摘要：

目的鉴定引起2012年深圳市罗湖区一起疱疹性咽峡炎暴发的病原体,并对鉴定的柯萨奇A4病毒(coxsackie virus A4,CVA4)的VP1基因进行全长的序列测定和遗传进化特征分析。方法采集罗湖区某幼儿园疱疹性咽峡炎暴发期间患儿的4份咽拭子样本和1份粪便标本,采用荧光RT-PCR法鉴定CVA4病毒,对阳性样本采用RT-PCR方法扩增CVA4病毒VP1区全长序列,并进行核苷酸序列测定和系统进化分析。结果病原学检测结果显示,引起此次疱疹性咽峡炎暴发的病原体为CVA4病毒。同源性分析显示,引起深圳疱疹性咽峡炎的CVA4病毒SZ-SK12030005、SZ-SK12030007与山东省2010株(KF150144)进化关系最近,核苷酸和氨基酸同源性分别为96.4%和99.5%;与2006年吉林株(JQ715708)的同源性最低,核苷酸和氨基酸同源性分别为87.9%和96.6%。VP1区亲缘进化树显示CVA4-SZ-SK12030005和CVA4-SZ-SK12030007属于GⅠB亚型。结论 GⅠB型CVA4病毒是引起此次深圳市疱疹性咽峡炎疫情的病原体。

引用

页码：860 / 862

页数：3

共 4 条

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