太平洋帕里西维拉海盆细菌多样性的非培养的初步分析

被引:10
作者
谢华
薛燕芬
赵爱民
李铁钢
马延和
曾艳
机构
[1] 中国科学院微生物研究所
[2] 中国生物技术发展中心
[3] 中国科学院海洋研究所
关键词
深海; 生物多样性; 非培养方法;
D O I
10.13343/j.cnki.wsxb.2005.01.001
中图分类号
Q93 [微生物学];
学科分类号
071005 ; 100705 ;
摘要
从环境中直接提取总DNA ,构建了含 32个有效转化子的太平洋帕里西维拉 (PareceVela)海盆 5 0 10米深处底泥的细菌 16SrRNA基因文库。测序结果表明 ,可以将 32条有效序列分为 17个不同的分类单元。大部分序列与已知细菌类群的 16SrDNA序列相似性较高 ,归属于Proteobacteria的gamma亚群、alpha亚群和海洋非培养细菌类群 ,主要分布在Pseudoalteromonas属、Halomonas属、Alcanivorax属、Photobacterium属、Acinetobacter属 ;部分序列与已知细菌类群的 16SrDNA序列同源性较低 ,可能代表新的分类单位。研究结果表明 ,帕里西维拉海盆不仅含有丰富的微生物物种 ,并且存在尚未被认识的新物种
引用
收藏
页码:1 / 5
页数:5
相关论文
共 4 条
[1]   Characterization of psychrotrophic bacteria in the surface and deep-sea waters from the northwestern Pacific Ocean based on 16S ribosomal DNA analysis [J].
Radjasa, OK ;
Urakawa, H ;
Kita-Tsukamoto, K ;
Ohwada, K .
MARINE BIOTECHNOLOGY, 2001, 3 (05) :454-462
[2]   Biodiversity in deep-sea sites located near the south part of Japan [J].
Takami, H ;
Kobata, K ;
Nagahama, T ;
Kobayashi, H ;
Inoue, A ;
Horikoshi, K .
EXTREMOPHILES, 1999, 3 (02) :97-102
[3]  
Microbial Diversity in Nankai Trough Sediments at a Depth of 3,843 m[J] . Lina Li,Jean Guenzennec,Peter Nichols,Pierre Henry,Miki Yanagibayashi,Chiaki Kato.Journal of Oceanography . 1999 (5)
[4]   Molecular analyses of the sediment of the 11000-m deep Mariana Trench [J].
Kato, C ;
Li, LN ;
Tamaoka, J ;
Horikoshi, K .
EXTREMOPHILES, 1997, 1 (03) :117-123