通用性引物RT-nPCR扩增不同基因型戊型肝炎病毒基因组的探讨

被引：4

作者：

周镇先

戴星

孟继鸿

机构：

[1] 东南大学医学院附属南京第二医院

[2] 东南大学附属中大医院

[3] 东南大学基础医学院病原生物学与免疫学系江苏南京

[4] 江苏南京

来源：

东南大学学报(医学版) | 2004年 / 03期

关键词：

戊型肝炎病毒; 基因型; 逆转录巢式聚合酶链反应;

D O I：

暂无

中图分类号：

R373.21 [];

学科分类号：

100103 ; 100705 ;

摘要：

目的 :筛选戊型肝炎病毒 (HEV)通用性引物 ,用于不同基因型HEV基因组的逆转录巢式聚合酶链扩增 (RT nPCR)。方法 :在HEV序列保守区设计和合成A、B、C、D 4组引物 ,用于扩增已知基因型的HEV参考株和HEVIgM阳性的临床标本 ,探讨扩增区域最小自由能与RT nPCR扩增效率的关系。结果 :4组引物均可扩增出不同基因型HEV基因片段 ,但得到的PCR滴度有差异 ,D组引物所得滴度最高 ,B组最低 ;5 4份临床标本的PCR阳性率也以D组最高、B组最低。D组引物扩增区段的RNA模板最小自由能的绝对值最低 ,B组的最高 ,与PCR扩增效率相关。结论 :在HEV基因组第 62 96～ 660 3核苷酸之间设计的D组通用性引物可扩增不同基因型HEV以及临床标本 ,扩增效率高 ,有较高的应用价值

引用

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共 3 条

[1] 不同基因型戊型肝炎病毒重组蛋白的抗原性分析 [J].