SSCP技术分析活性污泥微生物群落结构的条件优化及检验

被引:5
作者
王爱杰
阚洪晶
于振国
任南琪
刘春爽
张运晴
赵阳国
机构
[1] 哈尔滨工业大学市政环境工程学院
关键词
单链构象多态性; 条件优化; 检验; 微生物群落;
D O I
10.13344/j.microbiol.china.2008.07.016
中图分类号
Q93 [微生物学];
学科分类号
071005 ; 100705 ;
摘要
单链构象多态性(SSCP)技术是一种分析环境微生物遗传多态性的有效方法,具有快速、简便、灵敏等特点。但是,该技术用于分析复杂环境微生物群落结构时需要有针对性地优化操作条件。本研究针对聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)胶浓度、上样缓冲液中去离子甲酰胺浓度、电泳温度、电泳时间等确定了PCR-SSCP技术的优化条件,并以自养脱硫反硝化反应器启动期的活性污泥样品对此优化条件进行了检验,证明了16SrDNAV1V3区为靶对象时,丙烯酰胺与甲叉的质量比49:1,质量分数12%的聚丙烯酰胺凝胶,上样缓冲液中去离子甲酰胺的体积分数1/3,在4℃,300V,电泳18h是最优的操作条件,可以获较理想的SSCP图谱。
引用
收藏
页码:1164 / 1169
页数:6
相关论文
共 4 条
  • [1] PCR-SSCP分析条件的优化
    魏太云
    林含新
    谢联辉
    [J]. 福建农林大学学报(自然科学版), 2002, (01) : 22 - 25
  • [2] PCR-SSCP分析参数的研究
    杨志惠
    周斌
    贾静
    王闯
    张林
    [J]. 泸州医学院学报, 2005, (05) : 8 - 10
  • [3] Enhance the efficiency of single-strand conformation polymorphism analysis by short polyacrylamide gel and modified silver staining
    Zhang, ChunLei
    Wang, Yanhong
    Chen, Hong
    Lan, XianYong
    Lei, ChuZhao
    [J]. ANALYTICAL BIOCHEMISTRY, 2007, 365 (02) : 286 - 287
  • [4] Genomic mutations in the katG , inhA and aphC genes are useful for the prediction of isoniazid resistance in Mycobacterium tuberculosis isolates from Kwazulu Natal, South Africa[J] . P. Kiepiela,K.S. Bishop,A.N. Smith,L. Roux,D.F. York.Tubercle and Lung Disease . 2000 (1)