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模拟退火算法的一种改进及其在蛋白质结构预测中的应用
被引:41
作者
:
靳利霞
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机构:
大连理工大学管理科学与工程研究所,大连理工大学管理科学与工程研究所辽宁大连,辽宁大连
靳利霞
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唐焕文
机构
:
[1]
大连理工大学管理科学与工程研究所,大连理工大学管理科学与工程研究所辽宁大连,辽宁大连
来源
:
系统工程理论与实践
|
2002年
/ 09期
关键词
:
蛋白质结构预测;
连续函数;
全局优化;
模拟退火算法;
D O I
:
暂无
中图分类号
:
Q51 [蛋白质];
O224 [最优化的数学理论];
学科分类号
:
070105
[运筹学与控制论]
;
070307
[化学生物学]
;
摘要
:
根据蛋白质的氨基酸序列预测其空间结构可以归结为一个多维多极值的全局优化问题 ,缺少一种有效的全局优化方法是阻碍这一难题解决的一个关键 .文章以联合残基优化模型为基础 ,将蛋白质结构预测作为一个连续变量的全局优化问题来处理 .针对蛋白质结构预测模型的特点 ,对模拟退火算法进行了改进 ,并将其应用于脑啡肽和牛胰岛素 B(D)链的实例计算 ,得到了较为合理的结果
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[1]
蛋白质结构预测的优化模型与方法
[J].
唐焕文
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蛋白质空间结构预测的一种优化模型及算法
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(06)
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王义和
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1996,
(01)
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现代优化计算方法.[M].邢文训;谢金星编著;.清华大学出版社.1999,
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[1]
蛋白质结构预测的优化模型与方法
[J].
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蛋白质空间结构预测的一种优化模型及算法
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应用数学与计算数学学报,
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遗传算法的初步研究及改进后的遗传算法程序IGA 1.0
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一种高效的模拟退火全局优化算法
[J].
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模拟退火算法的背景与单调升温的模拟退火算法
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[8]
现代优化计算方法.[M].邢文训;谢金星编著;.清华大学出版社.1999,
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