模拟退火算法的一种改进及其在蛋白质结构预测中的应用

被引:41
作者
靳利霞
唐焕文
机构
[1] 大连理工大学管理科学与工程研究所,大连理工大学管理科学与工程研究所辽宁大连,辽宁大连
关键词
蛋白质结构预测; 连续函数; 全局优化; 模拟退火算法;
D O I
暂无
中图分类号
Q51 [蛋白质]; O224 [最优化的数学理论];
学科分类号
070105 [运筹学与控制论]; 070307 [化学生物学];
摘要
根据蛋白质的氨基酸序列预测其空间结构可以归结为一个多维多极值的全局优化问题 ,缺少一种有效的全局优化方法是阻碍这一难题解决的一个关键 .文章以联合残基优化模型为基础 ,将蛋白质结构预测作为一个连续变量的全局优化问题来处理 .针对蛋白质结构预测模型的特点 ,对模拟退火算法进行了改进 ,并将其应用于脑啡肽和牛胰岛素 B(D)链的实例计算 ,得到了较为合理的结果
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