猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)BJ-4株全基因组序列测定与分析

被引:48
作者
杨汉春
黄芳芳
郭鑫
高云
李华
陈声
机构
[1] 中国农业大学动物医学院农业部预防兽医学重点开放实验室
[2] 中国农业大学动物医学院农业部预防兽医学重点
关键词
PRRS病毒; 全基因组; 序列测定与分析;
D O I
暂无
中图分类号
S858.282.65 [];
学科分类号
摘要
在国内首次完成了猪繁殖与呼吸综合征病毒分离毒株的全基因组序列测定。用RT-PCR方法分段扩增出PRRSV北京地区分离株BJ-4株的21条cDNA片段,分别克隆于pGEM-T-easy质粒载体并进行测序,按顺序将这些序列进行拼接得到PRRSV BJ-4株全基因组cDNA序列。测序结果表明PRRSV BJ-4株基因组全长15 504 b,包含8个开放阅读框,5′端有190 nt先导序列;3′端有256 nt UTR,其中包括95 nt Poly(A)尾。PRRSV BJ-4株与美洲型毒株VR-2332和Nebreska的核苷酸同源率分别为99.5%和98.4%,而与欧洲型代表株LV株的核苷酸同源率为62.5%,与另一国内分离株CH-1a株编码结构蛋白基因的核苷酸同源率为93.3%。
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