三江源地区不同植被土壤固氮微生物的群落结构研究

被引:30
作者
张于光
王慧敏
李迪强
肖启明
刘学端
机构
[1] 湖南农业大学生物安全科技学院
[2] 中国林业科学院森林生态环境与保护研究所
关键词
nifH基因; 植被类型; 群落; PCR-RFLP分析;
D O I
10.13343/j.cnki.wsxb.2005.03.022
中图分类号
S154.381 [];
学科分类号
摘要
利用PCRRFLP和测序分析法对位于青藏高原腹地三江源自然保护区的高寒草甸、高寒草原和高山森林等不同植被类型的土壤固氮微生物的群落组成进行了探讨。经过PCRRFLP分析固氮基因nifH ,在3个样品中共得到2 33个克隆和99个可操作分类单元(OTUs) ,NQ1样地具有最多的克隆数和OTUs,多样性为4 9 74 % ,在所有样品中分别具有1~2个明显的优势种群(占总克隆数>15 % ) ,并且具有4个共同的OTUs。选取了2 6个克隆进行基因测序分析,通过DNAMAN比较表明,这些序列间具有6 6 %~98%的相似性,并且在GenBank数据库中没有发现完全匹配的序列,因此这些序列可能代表着新的固氮生物株系。最后利用ClustalW与Mega软件构建了系统发育树,结果发现,这些序列被分为4个不同的簇,部分序列与属于蛋白细菌(Proteobacteria)的已知细菌具有近的亲缘关系,但是更多的序列与已知细菌具有较远的亲缘关系,而且nifH基因序列的分布在样地间没有明显的聚类
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