福尔马林固定白鱀豚标本DNA提取及其遗传多样性的初步研究

被引:13
作者
许黎美
万秋红
王丁
机构
[1] 中国科学院水生生物研究所
[2] 浙江大学濒危野生动物保护遗传与繁殖教育部重点实验室
[3] 中国科学院水生生物研究所 武汉中国科学院研究生院
[4] 北京
[5] 杭州
[6] 武汉
关键词
福尔马林固定标本; DNA提取; 白鱀豚; 遗传多样性;
D O I
暂无
中图分类号
Q95-34 [动物标本的采集与制备];
学科分类号
071002 ;
摘要
福尔马林固定标本是宝贵的遗传资源,但是如何有效利用其中的遗传信息一直存在问题。本文尝试从标本预处理、消化、PCR扩增各方面综合考虑和优化改进,成功提取并扩增21头福尔马林固定白豚标本线粒体DNA控制区410bp片段。采用了3种预处理方法尽量去除固定标本中残存的甲醛,从试验结果来看,从酒精梯度+临界点干燥处理的标本中提取的DNA在扩增时具有明显优势。通过蛋白酶K消化过程中对于酶的浓度、温浴时间的比较试验,发现随着采用大幅提高酶浓度、延长消化时间等高强度的蛋白酶消化操作后,DNA的质量和产量均得到显著提高。针对标本DNA降解严重的特点,设计特异性好且长度合适的引物以及使用巢式引物扩增,均提高了标本DNA扩增的特异性和灵敏度。通过对所测得的21头白鱀豚线粒体DNA控制区部分序列的对比,发现全部个体在该片段上的序列完全一致,说明白豚遗传多样性极低。
引用
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