变性高效液相色谱法筛选鼻咽癌相关基因单核苷酸多态性

被引:3
作者
黄华
江培洲
沈新明
姚开泰
周宇凤
机构
[1] 第一军医大学肿瘤研究所,第一军医大学肿瘤研究所,第一军医大学肿瘤研究所,第一军医大学肿瘤研究所,珠江医院广东 广州 ,广东 广州 ,广东 广州 ,广东 广州 ,广东 广州
基金
广东省自然科学基金;
关键词
色谱法; 液相; 单核苷酸多态性; 基因; 肿瘤; 基因型; 鼻咽肿瘤;
D O I
暂无
中图分类号
R739.63 [咽肿瘤];
学科分类号
100214 ;
摘要
目的 利用变性高效液相色谱法(DHPLC)结合测序筛选和鉴定鼻咽癌基因的单核苷酸多态性(SNPs)。方法 PCR扩增30例鼻咽癌患者和28例正常对照者6p21.3区域基因PPP1R11、PP1R10、FLOT1、KIAA0170的4个外显子与1个内含子片断,采用DHPLC技术对扩增片断进行基因变异检测,将不同的类型PCR片断进行全序列测定并与参考序列对照分析。结果 在5个片断中初步鉴定出4个未见报道的新SNP位点,验证了4个已知的SNPs位点和基因型。结论 DHPLC预测结合全序列测序是一种高效、经济、简便、可靠的SNP筛选方法。
引用
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共 2 条
[1]  
分子克隆实验指南[M]. 科学出版社 , (美)J.萨姆布鲁克(J.Sambrook)等著, 1992
[2]  
A comparison of BRCA1 mutation analysis by direct sequencing, SSCP and DHPLC[J] . E. Gross,N. Arnold,J. Goette,U. Schwarz-Boeger,M. Kiechle.Human Genetics . 1999 (1-2)