从基因敲除小鼠心肌组织中筛选热休克反应中受HSF1调控的靶基因

被引:7
作者
刘瑛
袁灿
张华莉
王秋鹏
肖献忠
机构
[1] 中南大学湘雅医学院病理生理学教研室,中南大学湘雅医学院病理生理学教研室,中南大学湘雅医学院病理生理学教研室,中南大学湘雅医学院病理生理学教研室,中南大学湘雅医学院病理生理学教研室长沙,长沙,长沙,长沙,长沙
基金
国家自然科学基金重点项目; 湖南省自然科学基金;
关键词
cDNA芯片; HSF1; 热休克反应; 基因敲除; 小鼠; 心肌组织; HSE;
D O I
暂无
中图分类号
R363 [病理生理学];
学科分类号
摘要
目的 :用cDNA芯片从热休克转录因子 1(HSF1)基因敲除小鼠心肌组织中筛选热休克反应受HSF1调控的靶基因。方法 :用cDNA芯片检测热休克反应 (42℃ 15min ,恢复 3h)中HSF1 / 小鼠心肌组织基因表达谱的改变 (以HSF1+ / + 小鼠为对照 ) ;用RT PCR对cDNA芯片筛选结果进行验证 ;对差异表达的已命名基因进行启动子区转录因子结合位点的分析。结果 :共筛选到差异表达基因 114 2个 ;其中在HSF1 / 小鼠心肌中表达下调的基因为 398个 ,已命名基因为 173个 ;在HSF1 / 小鼠心肌中表达上调的基因为 6 4 1个 ,已命名基因为 2 35个。在HSF1 / 小鼠心肌中表达下调 2 .5倍的已命名基因中 ,有 5个基因启动子区含有热休克元件 (HSE) ;在HSF1 / 小鼠心肌中表达上调 2 .5倍的已命名基因中 ,有 6个基因启动子区含有HSE。结论 :在热休克反应中 ,HSF1可对多个基因的表达进行直接或间接的调控
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生物化学与生物物理进展, 2002, (03) :402-406