散发性戊型肝炎病毒部分核苷酸序列分析

被引:5
作者
阮冰
庄辉
马亦林
陈勇
干梦九
马伟杭
焦扬文
机构
[1] 浙江医科大学附属第一医院传染病科
[2] 北京医科大学微生物学系
[3] 浙江省医学科学院生物工程研究所
基金
浙江省自然科学基金;
关键词
戊型肝炎病毒,聚合酶链反应,序列分析;
D O I
暂无
中图分类号
R512.6 [病毒性肝炎];
学科分类号
100401 ;
摘要
目的为阐明戊型肝炎病毒(HEV)毒株的地理分布、流行特征以及研制血清学诊断试剂和基因工程疫苗提供资料。方法选择1例浙江仙居山区散发性HE患者,从其血清中分离HEVRNA,通过逆转录-套式聚合酶链反应法(RT-nPCR),扩增该散发性HEV(Z-33株)ORF2区部分cDNA片段(497bp),然后进行直接序列分析,并与HEV各主要代表株序列作比较。结果Z-33株与新疆流行株CH1.1的核苷酸及氨基酸序列同源性分别为96.7%及98.2%;与缅甸流行株的同源性分别为94.2%及99.1%;与缅甸散发株的同源性分别为95.2%及99.1%,与墨西哥株的同源性分别为81.8%及94.5%。结论浙江仙居散发性HEVZ-33株和新疆流行株CH1.1一样,与HEV缅甸株可能为同一亚型。
引用
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