黄尾鲴仔幼鱼阶段的食性是随着鳃耙和肠管形态的变化而变化。体长11.8—12.3mm,鳃耙形状开始分化,肠呈1—2弯曲,仔鱼吞食小型枝角类,主要是裸腹溞;体长15.8—17.4mm,口端位,鳃耙成筛网,肠呈4—8弯曲,前肠膨大,主要食物是腐屑,摇蚊幼虫,“水华”型的裸藻与蓝绿藻。体长18mm的幼鱼,口下位,鳃耙与肠管进一步发育,幼鱼转入底栖,其前肠内含物主要为泥沙、腐屑、摇蚊幼虫,浮游动物与浮游植物。黄尾鲴成鱼的主要食物为大量的腐屑和极少数的着生硅藻、颤藻。成鱼食物营养价值很差,其总N含量为0.372%,有机质为4.8%,每克湿重的热值为146.35卡,成鱼周年摄食,摄食量大,这是黄尾鲴摄食的特点。