本研究应用ISSR和SSR技术建立了 2 4个水稻光温敏核不育系的DNA指纹图谱 ,利用 13个ISSR引物和 2 0对SSR引物 ,分别获得 174个多态性片段和 6 2个多态性片段 ,平均每个ISSR引物检测到13 38个多态性片段 ,远远高于SSR引物的检测率。根据遗传距离进行的聚类分析表明 ,利用这两种标记所得的聚类结果十分相似 ,2 4个材料被聚为粳型 ,偏籼型和籼型三个类群 ,在籼型不育系类群内 ,又可明显的分成三个亚类群 ,其中 7个安农S - 1衍生的不育系聚为一类 ,与农垦 5 8S衍生的不育系有明显的遗传差异。根据两种标记计算的遗传距离及其遗传关系 ,所得的结果仍有一些差异 ,但总体趋势是一致。研究结果表明 ,ISSR和SSR标记适用于构建DNA指纹图谱 ,进行分类鉴定和遗传分析。