白花柽柳质膜水孔蛋白基因克隆及序列分析

被引:3
作者
董玉芝 [1 ]
杨传平 [1 ]
张道远 [2 ]
王玉成 [1 ]
机构
[1] 东北林业大学林学院
[2] 中国科学院新疆生态与地理研究所
关键词
白花柽柳; 植物水孔蛋白; 基因克隆; 序列分析;
D O I
暂无
中图分类号
S793.5 [柽柳];
学科分类号
0829 ; 0907 ;
摘要
植物水孔蛋白在植物体内形成水选择性运输通道,在植物种子萌发、细胞伸长、气孔运动、受精等过程中调节水分的快速跨膜运输。有的水孔蛋白还在干旱胁迫应答中起重要作用。本文根据白花柽柳的PEG6000胁迫处理构建的SSH消减文库的水孔蛋白基因表达序列标签(EST),设计基因特异性引物进行5′RACE,克隆出一个1043bp的核苷酸序列。应用生物信息学软件进行分析,预测该序列编码287个氨基酸,具有6个跨膜区,有MIP家族信号序列SGXHXN-PAVT,高等植物PIP高度保守序列GGGANXXXXGY和TGI/TNPARSL/FGAAI/VI/VF/YN,这是质膜水孔蛋白基因的典型的结构特征。经NCBI比对,与Arabidopsis thaliana(MIP-C),同源性达到95%,预测该蛋白的相对分子量是30·9KD,理论等电点是8·84。
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