富集培养的低温纤维素降解细菌菌群结构分析

被引：4

作者：

孟建宇

樊兆阳

李蘅

陶羽

王瑞刚

冯福应

机构：

[1] 内蒙古农业大学生命科学学院应用与环境微生物研究所

来源：

农业生物技术学报 | 2014年 / 22卷 / 05期

关键词：

低温纤维素降解菌; 富集培养; 群落结构; 变性梯度凝胶电泳(DGGE);

D O I：

暂无

中图分类号：

X172 [环境微生物学];

学科分类号：

摘要：

内蒙古大兴安岭森林土壤中低温纤维素降解菌资源丰富,本研究旨在分析其菌群结构。在10℃下,用羧甲基纤维素钠(CMC-Na)培养基对样品中的低温纤维素降解菌进行富集传代培养,用3,5-二硝基水杨酸(DNS)法测定纤维素酶活性,以细菌16S rDNA通用引物(34lF和907R)进行V3～V5区域PCR扩增,以变性梯度凝胶电泳(DGGE)对PCR产物进行电泳,获得16S rDNA指纹图谱后分析细菌菌群结构。研究结果表明,低温富集传代过程中,相对酶活随着培养代数的增加而不断增加,第4代的相对酶活最高,为30.625 IU;每代都有菌种的消失和增加;富集培养液中包含属于α-变形菌纲(α-Proteobacteria)、β-变形菌纲(β-Proteobacteria)、γ-变形菌纲(γ-Proteobacteria)、硬壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)类群的细菌,其中硬壁菌门类群(65.5%)和β-变形菌纲类群(13.8%)的细菌为优势菌。本研究证实,内蒙古大兴安岭森林土壤有丰富的低温纤维素降解菌资源,有潜在的应用前景。

引用

页码：607 / 614

页数：8

共 26 条

[1]

应用微生物分子生态学方法研究对虾肠道细菌组成及其变化规律.[D].刘淮德.中国科学院研究生院（海洋研究所）.2010, 10

[2]

选矿废水处理系统中微生物群落结构分析.[D].罗丽丽.广东工业大学.2011, 11

[3]

黄栌林土壤微生物多样性研究.[D].吴佳徽.北京林业大学.2011, 10

[4]

玉米秸秆腐解复合菌系CSS-1的构建、菌群组成及腐解特性研究.[D].刘尧.山东农业大学.2010, 06

[5] Impact of lignins isolated from pretreated lignocelluloses on enzymatic cellulose saccharification [J].

Barsberg, Soren ;

Selig, Michael Joseph ;

Felby, Claus .

BIOTECHNOLOGY LETTERS, 2013, 35 (02) :189-195

[6]

Isolation of Cellulose-Degrading Bacteria and Determination of Their Cellulolytic Potential.[J].Pratima Gupta;Kalpana Samant;Avinash Sahu;Todd R. Callaway.International Journal of Microbiology.2012,

[7]

Extracellular hydrolytic enzyme screening of culturable heterotrophic bacteria from deep-sea sediments of the Southern Okinawa Trough.[J].Hongyue Dang;Hu Zhu;Jing Wang;Tiegang Li.World Journal of Microbiology and Biotechnology.2009, 1

[8]

Lignocellulosic residues: Biodegradation and bioconversion by fungi.[J].Carmen Sánchez.Biotechnology Advances.2008, 2

[9] Bioconversion of lignocellulosic biomass: biochemical and molecular perspectives [J].

Kumar, Raj ;

Singh, Sompal ;

Singh, Om V. .

JOURNAL OF INDUSTRIAL MICROBIOLOGY & BIOTECHNOLOGY, 2008, 35 (05) :377-391

[10] A survey of the relative abundance of specific groups of cellulose degrading bacteria in anaerobic environments using fluorescence in situ hybridization [J].

O'Sullivan, C. ;

Burrell, P. C. ;

Clarke, W. P. ;

Blackall, L. L. .

JOURNAL OF APPLIED MICROBIOLOGY, 2007, 103 (04) :1332-1343

← 1 2 3 →