中国近海黑鲷线粒体DNA控制区序列多态性分析

被引:9
作者
龚金波 [1 ]
苏天凤 [2 ]
夏军红 [2 ]
龚世园 [1 ]
江世贵 [2 ]
机构
[1] 华中农业大学水产学院
[2] 中国水产科学研究院南海水产研究所
基金
广东省科技计划;
关键词
黑鲷; DNA序列; 线粒体控制区; 多态性;
D O I
暂无
中图分类号
S917.4 [水产动物学];
学科分类号
摘要
采用聚合酶链式反应(PCR)和直接测序的方法,测定了广西北海、广东深圳和山东青岛3个地理群体共72尾黑鲷(Acanthopagrusschlegeli)线粒体Dloop第一高变区5′端547~549bp序列,以探讨黑鲷种群的遗传变异。分析结果表明:72条序列T、C、A、G4种核苷酸的平均含量分别为30.8%、21.8%、36.3%、11.0%。共检测到55个变异位点,其中转换位点32个,颠换位点19个,缺失/颠换位点1个,插入/颠换位点3个。72个个体具有51种单倍型(haplotype),单倍型比率为70.8%,黑鲷线粒体Dloop控制区表现出较为丰富的核苷酸多态性。对其所有单倍型依据序列距离使用NJ法构建的亲缘关系树并无明显的系谱分支,没有显示出明显的地理分布族群,说明黑鲷线粒体DNA控制区第一高变区序列无法用于黑鲷种群的鉴别。
引用
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