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支持向量机用于定量构效关系建模的研究
被引:23
作者:
梅虎
梁桂兆
周原
李志良
机构:
[1] 生物医学工程教育部与重庆市重点实验室
[2] 重庆大学生物工程学院
来源:
关键词:
支持向量机;
偏最小二乘;
BP人工神经网络;
定量构效关系;
D O I:
暂无
中图分类号:
TP18 [人工智能理论];
学科分类号:
081104 ;
0812 ;
0835 ;
1405 ;
摘要:
运用支持向量机,偏最小二乘和BP人工神经网络3种方法对苦味二肽和血管紧张素转化酶抑制剂2个肽体系进行了定量构效关系建模研究.为了验证模型的外部预测能力,样本集经D-optimal设计被分成训练集和测试集两部分,通过对测试集的预测结果来判断模型的外部预测能力.结果显示支持向量机在2个体系中均表现出了较强的建模和预测能力.在对苦味二肽的构效关系建模中,支持向量机的建模和预测结果明显优于偏最小二乘,与BP人工神经网络相比,虽然在建模能力上支持向量机略逊于BP神经网络,但其预测能力却明显优于BP神经网络;而对于血管紧张素转化酶抑制剂,支持向量机的建模和预测结果则略优于偏最小二乘和BP人工神经网络.其中采用线性核和径向基核的支持向量机模型在两个肽体系中建模和预测结果相当.研究显示支持向量机在药物的定量构效关系研究中具有广阔的应用前景.
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