从棉花ESTs数据库中筛选微卫星标记的初步研究

被引:22
作者
李华盛
范术丽
沈法富
机构
[1] 山东农业大学农学院
[2] 中国农业科学院棉花研究所 农业部棉花遗传改良重点开放实验室
[3] 山东农业大学农学院 山东 泰安
[4] 安阳
[5] 山东 泰安
关键词
棉花; 表达序列标签; 微卫星; 通用性分析;
D O I
暂无
中图分类号
S562 [棉];
学科分类号
0901 ;
摘要
利用生物信息学方法在含有94709条棉花EST序列的数据库中进行微卫星标记筛选,共发现微卫星序列4396个,占整个EST数据库的4.64%。其中双碱基重复序列1282个、三碱基序列2411个,分别占在EST数据库中发现微卫星序列总数的29.27%和54.8%。根据筛选到的微卫星序列设计并合成引物25对,其中24对引物有扩增产物,17对产物条带比较清晰,对这些条带比较清晰的产物作了一系列的分析。
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