构建高质量微生物天然产物库研究策略

被引：3

作者：

边疆 ^{[1
]}

宋福行 ^{[2
]}

张立新 ^{[1
]}

机构：

[1] 中国科学院南海海洋研究所

[2] 中国科学院微生物研究所

来源：

微生物学报 | 2008年 / 08期

关键词：

微生物天然产物库; 化学微生物学; 宏基因组技术; 去重复化; 高通量互动筛选;

D O I：

10.13343/j.cnki.wsxb.2008.08.020

中图分类号：

R28 [中药学];

学科分类号：

1008 ;

摘要：

微生物次级代谢产物历来是天然药物的重要来源,过去曾被称为"生物沙漠"的海洋,由于从中分离到大量新的微生物、基因及生物活性化合物,被重新认识逆转而成为一种"生物多样化的热带雨林"。构建一个高质量微生物库及其天然产物库是保证药物和其他筛选成功的前提和关键。但如何高效建立高质量微生物天然产物库仍面临很多瓶颈问题。我们拟从:(1)扩大可培养微生物的多样性及去重复化;(2)扩大基因资源多样性及去重复化;(3)扩大微生物次级代谢产物多样性及去重复化;(4)寻找崭新次级代谢产物的新技术新方法,特别是针对多靶位药物的高通量互动筛选方面提出应对的研究策略。利用上述化学微生物学策略分离生物活性化合物不仅在生物技术和制药学应用中显现重要性,也增加了我们对微生物的多样性、生态系统功能和应用生物学的理解。

引用

页码：1132 / 1137

页数：6

共 14 条

[1] 多聚酮的微生物合成及其多样性研究进展 [J].

任立成 ;

鲍时翔 .

微生物学通报, 2007, (01) :127-131

[2] 非核糖体多肽合成酶研究进展 [J].

明镇寰 ;

潘建伟 ;

朱睦元 .

生物化学与生物物理进展, 2002, (05) :667-669

[3] Isolation and characterization of a metagenome-derived and cold-active lipase with high stereospecificity for (R)-ibuprofen esters [J].

Elend, C. ;

Schmeisser, C. ;

Hoebenreich, H. ;

Steele, H. L. ;

Streit, W. R. .

JOURNAL OF BIOTECHNOLOGY, 2007, 130 (04) :370-377

[4] Rapid screening of a large insert BAC library for specific 16S rRNA genes using TRFLP [J].

Babcock, D. A. ;

Wawrik, B. ;

Paul, J. H. ;

McGuinness, L. ;

Kerkhof, L. J. .

JOURNAL OF MICROBIOLOGICAL METHODS, 2007, 71 (02) :156-161

[5] Comparative study of methods for extraction and purification of environmental DNA from soil and sludge samples [J].

Roh, Chanchyun ;

Villatte, Francois ;

Kim, Byung-Gee ;

Schmid, Rolf D. .

APPLIED BIOCHEMISTRY AND BIOTECHNOLOGY, 2006, 134 (02) :97-112

[6] Diversity and biogeography of marine actinobacteria [J].

Ward, Alan C. ;

Bora, Nagamani .

CURRENT OPINION IN MICROBIOLOGY, 2006, 9 (03) :279-286

[7]

CASE STUDY: High Throughput Cultivation for Isolation of Novel Marine Microorganisms[J] . Oceanography . 2006 (2)

[8] Cloning and heterologous expression of isocyanide biosynthetic genes from environmental DNA [J].

Brady, SF ;

Clardy, J .

ANGEWANDTE CHEMIE-INTERNATIONAL EDITION, 2005, 44 (43) :7063-7065

[9] Exploring novel bioactive compounds from marine microbes [J].

Zhang, LX ;

An, R ;

Wang, JP ;

Sun, N ;

Zhang, S ;

Hu, JC ;

Kuai, J .

CURRENT OPINION IN MICROBIOLOGY, 2005, 8 (03) :276-281

[10]

Diversifying microbial natural products for drug discovery[J] . V. Knight,J.-J. Sanglier,D. DiTullio,S. Braccili,P. Bonner,J. Waters,D. Hughes,L. Zhang.Applied Microbiology and Biotechnology . 2003 (5)

← 1 2 →