湖南沙子岭猪SLA-DR基因克隆及生物信息学分析

被引：8

作者：

唐医亚 ^{[1
]}

邢晓为 ^{[1
]}

薛立群 ^{[2
]}

黄生强 ^{[2
]}

王维 ^{[1
]}

机构：

[1] 中南大学湘雅三医院细胞移植与基因治疗中心

[2] 湖南农业大学动物科学技术学院

来源：

遗传 | 2007年 / 12期

关键词：

猪白细胞抗原; 沙子岭猪; 基因克隆; 异种移植;

D O I：

10.16288/j.yczz.2007.12.013

中图分类号：

S828 [猪]; Q78 [基因工程（遗传工程）];

学科分类号：

071007 ; 0836 ; 090102 ;

摘要：

为了克隆湖南沙子岭猪SLA-DRA和SLA-DRB基因,分析SLA基因特性和抗原多态性,评价湖南沙子岭猪在异种移植中的应用前景奠定基础。应用RT-PCR分别扩增湖南沙子岭猪SLA-DRA和SLA-DRB基因,鉴定后克隆到PUCm-T载体并进行测序,用NCBI中的BLAST和ExPASY中相关软件进行生物信息学分析。得到的湖南沙子岭猪SLA-DRA和SLA-DRB基因特异性基因片段,大小分别为1 177 bp和909 bp。生物信息学分析发现,所扩增的SLA-DRA和SLA-DRB基因片段均包含完整的开放阅读框,分别编码252和266个氨基酸残基。将湖南沙子岭猪SLA-DRA和SLA-DRB基因在GenBank登录,登录号分别为EF143987和EF143988。同源性分析发现,湖南沙子岭猪SLA-DRA和SLA-DRB与人类相应的DRA、DRB相比,核苷酸序列同源性分别为83%和83%,编码氨基酸同源性分别为83%和79%。与GenBank登录的其他猪种相比,SLA-DRA基因同源性最高可达100%,而SLA-DRB基因具有多态性。

引用

页码：1491 / 1496

页数：6

共 10 条

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