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细基江蓠及其繁枝变种的RAPD和ITS分析
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覃志彪
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郭亚芬
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[1] 中国海洋大学水产学院
[2] 广西大学水产系
[3] 中国科学院海洋研究所
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关键词:
细基江蓠;
细基江蓠繁枝变种;
RAPD;
ITS;
分类;
鉴定;
D O I:
暂无
中图分类号:
Q943 [植物细胞遗传学];
学科分类号:
071007 ;
090102 ;
摘要:
对细基江蓠及其繁枝变种各12个个体进行随机扩增多态性(RAPD)DNA分析,对比多态位点比例、平均杂合度以及遗传距离,并构建UPGMA聚类图;通过PCR扩增出核糖体RNA基因(rDNA)转录间隔区(ITS),纯化后直接测序,利用生物信息学方法进行序列分析和核苷酸变异研究.比较分析结果表明,细基江蓠的杂合度和多态位点比例均高于细基江蓠繁枝变种,其遗传多样性相对较丰富;实验中8条随机引物扩增出特异的RAPD带,可用做细基江蓠及其繁枝变种的分子鉴定标记;ITS序列在这两种海藻中变异极小;RAPD和ITS聚类分析研究结果表明,细基江蓠及其繁枝变种均聚集为一枝,与同属不同种的龙须菜和真江蓠分开,提示细基江蓠和及其繁枝变种为同一个种,从而在DNA水平上支持了传统形态分类的观点.
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叶富良
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刘东超
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王斌
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赵谋明
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邱慧霞
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彭志英
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黄粤宁
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机构: 华南理工大学食品工程系!广州