大肠埃希菌蛋白指纹图谱的建立

被引：4

作者：

肖代雯 ^{[1
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杨永长 ^{[1
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喻华 ^{[1
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刘华 ^{[1
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黄文芳 ^{[1
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黄波 ^{[2
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胡琦 ^{[2
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廖维金 ^{[1
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机构：

[1] 四川省医学科学院四川省人民医院检验科

[2] 重庆医科大学医学检验系

来源：

中国微生态学杂志 | 2008年 / 05期

关键词：

大肠埃希菌; 蛋白指纹; 表面增强激光解析电离飞行时间质谱;

D O I：

10.13381/j.cnki.cjm.2008.05.016

中图分类号：

R446.5 [微生物学检验]; R450 [];

学科分类号：

100208 ; 100215 ;

摘要：

目的建立大肠埃希菌(Escherichia coli,E.coli)蛋白指纹图谱,为E.coli感染快速诊断奠定基础。方法收集临床分离E.coli88株,提取细菌DNA,PCR检测E.coli16S rRNA。蛋白提取液提取细菌蛋白,干化学法测蛋白浓度,应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)检测E.coli蛋白,采用Ciphergen Pro-teinchip软件自动采集数据。重复测定20次E.coli混合标本,评价SELDI检测E.coli蛋白分子量的重复性。结果E.coli标准菌株ATCC 25922和临床分离株均可检出16SrRNA。AU芯片能捕获近30个E.coli蛋白峰,其中19个蛋白峰构成E.coli特征性蛋白指纹图谱,各蛋白峰在临床分离E.coli间分子量变异系数≤0.2%。SELDI重复检测20次E.coli混合标本显示同一蛋白峰的分子量变异系数≤0.05%。结论E.coli在分子量320kD范围内具有特征性蛋白指纹图谱,为快速诊断E.coli感染提供了新思路。

引用

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