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转基因玉米EPSPS蛋白适体的筛选与结构分析
被引:5
作者
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江树勋
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陈洪俊
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陈洪俊
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陈文炳
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吴亚君
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潘大仁
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:
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[2]
福建农林大学生命科学学院
[3]
中国检验检疫科学研究院
来源
:
热带作物学报
|
2010年
/ 04期
关键词
:
转基因玉米;
EPSPS蛋白;
SELEX;
适体;
结构;
D O I
:
暂无
中图分类号
:
S513 [玉米(玉蜀黍)];
学科分类号
:
摘要
:
通过体外合成长度为70个碱基的随机ssDNA文库,采用指数富集配基的系统进化(SELEX)技术,以转基因玉米EPSPS蛋白为靶目标进行16轮筛选,将筛选到的适体群进行克隆、测序,初步获得与转基因玉米EPSPS蛋白特异性结合的适体。并用Macaw2.05和DNAMAN软件对每个适体的保守序列和二级结构进行分析。结果表明:一级结构分析序列同源性可分为四大群,其中A群有11条序列含有67个保守碱基;二级结构分析结果表明,茎环状和口袋状等结构可能是适体与转基因玉米EPSPS蛋白结合的结构基础。利用SELEX技术获得与转基因玉米EPSPS蛋白特异结合的适体群,其一级和二级结构与亲和力密切相关。
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