S7核糖体蛋白基因序列变异及其在低等鲤科鱼类中的系统发育意义

被引:14
作者
王绪桢
何舜平
陈宜瑜
不详
机构
[1] 中国科学院水生生物研究所
[2] 中国科学院水生生物研究所 武汉
[3] 武汉
关键词
S7核糖体蛋白基因; 系统发育; 鲤科; 序列变异; 内含子;
D O I
暂无
中图分类号
Q959.4 [鱼纲];
学科分类号
071002 ;
摘要
鲤科是世界鱼类中最大的科,有210余属2010种.为研究其系统发育关系需要筛选合适的DNA标记.将S7核糖体蛋白基因用作遗传标记进行鲤科鱼类的系统发育分析.通过PCR方法,扩增了长度为602bp的胭脂鱼以及长度为655~859bp的16种鲤科鱼类的S7基因内含子1序列.序列排列得到925个排列位点,其中信息位点499个,占全部位点的54%.结果表明,鲤科鱼类S7基因内含子1序列具有丰富的信息位点,并且在亲缘关系不同的物种间存在显著的序列差异.基于S7基因内含子1序列的NJ(neighbor-joining)和MP(most-parsimony)分支树经1000次重复抽样检验后,节点的自展支持率普遍高于以细胞色素b及线粒体控制区(d-loop)基因为遗传标记时所得到的分支树.因此,S7基因内含子1作为遗传标记在鲤科系统发育研究中的分辨率是比较高的,它是一个适合鲤科内亚科水平系统发育研究的有用的分子遗传标记.但S7基因内含子1是否适用于鲤形目科间或科以上水平的分子系统学分析,有待进一步研究.
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