可变数目串联重复序列在上海崇明岛地区结核分枝杆菌北京基因型菌株微进化研究中的应用

被引：4

作者：

乔可 ^{[1
]}

王辉 ^{[1
]}

杨崇广 ^{[1
]}

罗涛 ^{[1
]}

梅建 ^{[2
]}

高谦 ^{[1
]}

机构：

[1] 复旦大学上海医学院教育部/卫生部医学分子病毒学重点实验室

[2] 上海市疾病预防控制中心结核病防治科

来源：

微生物与感染 | 2010年 / 5卷 / 04期

关键词：

结核分枝杆菌; 北京基因型; 可变数目串联重复序列; 单核苷酸多态性; 最小生成树; 微进化;

D O I：

暂无

中图分类号：

R378 [病原细菌];

学科分类号：

100103 ; 100705 ;

摘要：

本文通过对上海市疾病预防控制中心收集并保存的、来源于上海崇明岛地区痰培养阳性肺结核患者的135株结核分枝杆菌北京基因型菌株进行可变数目串联重复序列(VNTR)和单核苷酸多态性(SNP)基因分型,并构建最小生成树(MST),来寻找适合研究北京基因型菌株微进化的VNTR组合及区分不同亚型的分子标志。结果显示,16位点VNTR与SNP的分型结果最匹配,适合于研究该地区北京基因型菌株的微进化;SNP单倍型主要集中在ST10(42.2%)、ST19(30.4%)、ST22(14.1%)3个类型;4个VNTR位点(Mtub21、QUB26、MIRU16和QUB4156)可能是区分北京基因型菌株不同亚型的分子标志。

引用

页码：208 / 213

页数：6

共 8 条

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