基于PC/Linux的核酸序列分析系统的构建及其应用附视频

被引:15
作者
张成岗
欧阳曙光
张绍文
瞿祥虎
鱼咏涛
周钢桥
吴松锋
贺福初
机构
[1] 军事医学科学院放射医学研究所基因组学与蛋白质组学研究室!北京
[2] 军事医学科学院放射医学研究所基因组学与蛋白质组学研究室!北
基金
国家杰出青年科学基金;
关键词
PC机; Linux操作系统; Phred/Phrap/Consed软件; Blast软件; 生物信息学; 大规模测序;
D O I
暂无
中图分类号
Q754 [基因的结构和突变的分子原理];
学科分类号
摘要
基于PC机和Linux操作系统 ,利用Phred/Phrap/Consed软件和Blast软件 ,构建了核酸序列大规模自动分析系统 .该套系统可自动完成从测序峰图向核酸序列的转化、载体序列去除、序列自动拼接、重复序列鉴定以及序列的相似性分析 ,可加速对大规模测序数据的分析和利用 .
引用
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页数:4
相关论文
共 1 条
[1]   序列同源性比较软件Blast的本地化实现及VB接口程序的编制 [J].
张成岗 ;
张绍文 ;
鱼咏涛 ;
欧阳曙光 ;
周钢桥 ;
罗凌 ;
贺福初 .
生物化学与生物物理进展, 1999, (05) :517-519