RNA二级结构预测系统构建

被引：11

作者：

李伍举，吴加金

机构：

[1] 军事医学科学院基础医学研究所

来源：

生物化学与生物物理进展 | 1996年 / 05期

关键词：

RNA二级结构，预测，比较;

D O I：

暂无

中图分类号：

Q522.01 [];

学科分类号：

摘要：

运用下列ＲＮＡ二级结构预测算法：碱基最大配对方法、Ｚｕｋｅｒ极小化自由能方法、螺旋区最优堆积、螺旋区随机堆积和所有可能组合方法与基于一级螺旋区的ＲＮＡ二级结构绘图技术，构建了ＲＮＡ二级结构预测系统Ｒｎａｆｏｌｄ．另外，通过随机选取２０个ｔＲＮＡ序列，从自由能和三叶草结构两个方面比较了前４种二级结构预测算法，并运用ｔ检验方法分析了自由能的统计学差别．从三叶草结构来看，以随机堆积方法最好，其次是螺旋区最优堆积方法和Ｚｕｋｅｒ算法，以碱基最大配对方法最差．最后，分析了两种极小化自由能方法之间的差别．

引用

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