黑麂线粒体基因组序列分析

被引:13
作者
张海军
李健
施燕峰
张晓梅
徐春宏
单祥年
机构
[1] 东南大学医学院遗传中心,东南大学医学院遗传中心,东南大学医学院遗传中心,东南大学医学院遗传中心,东南大学医学院遗传中心,东南大学医学院遗传中心南京,南京,南京,南京,南京,南京
关键词
黑麂; 线粒体基因组; 种系进化树;
D O I
10.13865/j.cnki.cjbmb.2004.04.022
中图分类号
Q953 [动物遗传学];
学科分类号
071007 ; 090501 ;
摘要
采用PCR产物直接测序方法测定了黑麂线粒体基因组全序列 ,初步分析了其基因组特点并定位了各基因的位置 .结果显示 :黑麂的线粒体基因组全序列长度为 1 6 35 7bp ,可编码 2 2种tRNA、2种rRNA、1 3种蛋白质 ,碱基组成及基因位置与小麂、赤麂和其它哺乳类动物的线粒体基因组相似 ;模拟电子酶切图谱与先前的报道基本一致 ;基于细胞色素b的全基因序列 ,分别以最大简约法、N J法、最大似然数法与其它 1 4种鹿类动物的相应序列进行了聚类分析 ,构建出相似的系统进化树 :初步确定了麂亚科动物在鹿科中处于与鹿亚科、北美鹿亚科并列的进化地位 .在此基础上 ,进一步以黑麂、赤麂、小麂的线粒体编码RNA和编码蛋白质的基因序列构建系统进化树 ,分析了三者的亲缘关系 .结果表明 :黑麂和赤麂亲缘关系较近 ,是较新的物种 ,而小麂是较为原始的物种
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