鲥鱼、太湖新银鱼和大银鱼18S rRNA基因的克隆与序列分析

被引:15
作者
张际峰
汪承润
王顺昌
王春花
机构
[1] 淮南师范学院生命科学系
关键词
鲥鱼; 太湖新银鱼; 大银鱼; 18S rRNA基因; 系统分析;
D O I
10.14188/j.1671-8836.2010.01.017
中图分类号
S917.4 [水产动物学];
学科分类号
090805 [渔业资源学];
摘要
本文利用多对引物,扩增并测定出鲥鱼、太湖新银鱼和大银鱼18S rRNA基因部分序列,其长度均为1206bp,其中太湖新银鱼与大银鱼基因序列完全相同.将3种经济鱼类与GenBank中10种脊椎动物及头索动物文昌鱼的18S rRNA基因同源序列进行比对分析,计算出序列碱基组成、序列间差异百分比和转换/颠换数值.基于18S rRNA基因序列,利用NJ法、ML法和BI法3种聚类方法,以文昌鱼为外群,构建13种脊椎动物的分子系统树,3种方法获得拓扑学结构一致的系统树.系统树包括3大支,一支为哺乳类、鸟类和爬行类共6个物种,一支为两栖类的2个物种,另一支为5种硬骨鱼类.结果表明:鸟类与哺乳类亲缘关系较近,而胡瓜鱼目与鲑形目亲缘关系近于鲱形目.此外,本文还讨论了脊椎动物18S rRNA基因的序列特征.
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