运行于磁珠表面的可编程DNA计算机

被引:2
作者
赵健
张治洲
师咏勇
李秀霞
贺林
机构
[1] 上海交通大学Bio-X生命科学研究中心
[2] 上海交通大学Bio-X生命科学研究中心 上海
[3] 上海
关键词
DNA; 计算; 自动机; 表面; 可编程;
D O I
暂无
中图分类号
TP338 [各种电子数字计算机];
学科分类号
081201 ;
摘要
后基因组时代涌现出DNA操作技术一系列新的应用,其中包括建立在DNA分子基础上的生物计算机.至今还没有在固体表面实现基于自动机原理的DNA计算的相关报道.本文描述了一种可编程的DNA计算装置——具有图灵机部分功能的有限自动机,并且将计算过程转移到了固体表面.DNA计算机主要由DNA分子(输入分子,输出状态检测分子和充当软件的状态转移分子等)、DNA限制性内切酶及连接酶和所需的缓冲液组成,可以自动地解决计算问题.将荧光标记在输入分子的5’端,以便于动态跟踪监测反应过程中的各种中间产物.这些工作具有如下的特点:(1)成功地在磁珠表面实现了可编程的DNA计算机——有限状态自动机.(2)通过毛细管电泳直接监测所有的DNA计算中间产物.DNA计算机的超大并行计算能力具有通过自动控制来得以实现的可行性,为在不久的将来把大规模的DNA计算和功能基因组研究结合起来奠定了基础.
引用
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页码:2422 / 2427
页数:6
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[1]   DNA计算机的分子生物学研究进展 [J].
张治洲 ;
赵健 ;
贺林 .
遗传学报, 2003, (09) :886-892
[2]   DNA计算与生物数学 [J].
孟大志 ;
曹海萍 .
生物物理学报, 2002, (02) :163-174
[3]   DNA计算机的研究和展望 [J].
陈惟昌 ;
陈志华 ;
邱红霞 ;
王自强 .
生物化学与生物物理进展, 2001, (02) :156-159
[4]  
DNA计算与软计算[M]. 科学出版社 , 丁永生等著, 2002
[5]  
DNA molecule provides a computing machine with both data and fuel .2 Benenson Y,Adar R,Paz-Elizur T,et al. Proc Natl Acad Sci USA . 2003