应用抑制差减杂交法分离水稻幼穗发育早期特异表达的基因

被引：21

作者：

刘军

袁自强

刘建东

钱晓茵

钱旻

杨金水

机构：

[1] 复旦大学生命科学学院遗传研究所!上海

来源：

科学通报 | 2000年 / 13期

关键词：

抑制差减杂交技术; 茎尖分生组织; 幼穗分生组织;

D O I：

暂无

中图分类号：

Q943.2 [植物基因工程];

学科分类号：

071007 ; 090102 ;

摘要：

以水稻茎尖分生组织（ｓｈｏｏｔａｐｉｃａｌｍｅｒｉｓｔｅｍ，ＳＡＭ）为对照群体，幼穗分生组织（ｐｒｉｍａｒｙａｎｄｓｅｃｏｎｄａｒｙｂｒａｎｃｈｐｒｉｍｏｒｄｉａ，Ｐｂ／Ｓｂ）为目标群体，进行抑制差减杂交．用经过ＳＡＭｃＤＮＡ差减的Ｐｂ／ＳｂｃＤＮＡ群体构建了一个差减文库通过差示筛选鉴定了４０个在Ｐｂ／Ｓｂ中特异表达或表达增强的候选克隆．Ｎｏｒｔｈｅｒｎ杂交验证，至少４０％的候选克隆代表了在Ｐｂ／Ｓｂ中特异表达或表达增强的基因，同时，相当一部分克隆为低丰度转录本．对４０个ｃＤＮＡ克隆单向测序后，与ＧｅｎＢａｎｋ中同源序列进行比较，结果表明：２个克隆为已知水稻基因；１１个克隆与已知基因的同源性为６０％～９０％；另有１８个克隆在ＧｅｎＢａｎｋ中无法查到对应的同源基因，可能代表了新基因，或是由于序列位于变异丰富的３＇端故而无法查到与其他物种基因的同源性．目前为止，已有１９个基因在ＧｅｎＢａｎｋ注册并获登录号．

引用

页码：1392 / 1397

页数：6

共 1 条

[1]

Equalizing cDNA Subtraction Based on Selective Suppression of Polymerase Chain Reaction: Cloning of Jurkat Cell Transcripts Induced by Phytohemaglutinin and Phorbol 12-Myristate 13-Acetate[J] . Nadya G. Gurskaya,Luda Diatchenko,Alex Chenchik,Paul D. Siebert,George L. Khaspekov,Konstantin A. Lukyanov,Laura L. Vagner,Olga D. Ermolaeva,Sergey A. Lukyanov,Eugene D. Sverdlov.Analytical Biochemistry . 1996 (1)

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