短杆菌肽A-DMPC通道内离子输运的分子动力学模拟

被引：4

作者：

陈慰祖

汤宇舟

王存新

机构：

[1] 北京工业大学生物医学工程中心!北京,中国科学技术大学天文与应用物理系!安徽合肥,北京工业大学生物医学工程中心!北京

来源：

生物物理学报 | 2000年 / 03期

基金：

北京市自然科学基金;

关键词：

短杆菌肽A-DMPC通道; 离子输运; 分子动力学模拟;

D O I：

暂无

中图分类号：

Q27 [细胞生物物理学];

学科分类号：

摘要：

用最近提出的构建膜体系初始构象的有效方法 ,构建了在DMPC脂膜环境下短杆菌肽A通道模型 (GA -DMPC)。通过对Na +、Ca2 +、Cl-三种不同离子在GA -DMPC通道内不同位置的分子动力学模拟 ,研究离子在通道内输运过程中与通道及通道内水分子的相互作用 ,从分子动力学的角度阐明离子在通道内的输运机制。主要计算结果表明 :(1)离子在通道内的输运使GA的构象发生变化 ,GA的柔性是离子在通道内通透的重要因素 ;(2)Cl- 离子可扩大通道半径 ,Na+ 离子和Ca2 +离子则减小通道半径。Cl-离子不能在GA通道内通透 ;(3)离子的出现使通道内水分子的偶极方向发生变化。上述结果均与实验相符。

引用

页码：569 / 576

页数：8

共 9 条

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