拟南芥基因密码子偏爱性分析

被引:57
作者
范三红
郭蔼光
单丽伟
胡小平
机构
[1] 西北农林科技大学
关键词
拟南芥; 密码子偏爱性; XML;
D O I
暂无
中图分类号
Q943 [植物细胞遗传学];
学科分类号
071007 ; 090102 ;
摘要
密码子偏爱性对外源基因的表达强度有一定影响 ,特别是编码蛋白质N端 7~ 8个氨基酸残基的密码子 .通过对拟南芥染色体中 2 6 82 7个蛋白质对应的基因密码子进行分析 ,得到了编码氨基酸的 6 1种密码子在拟南芥中的使用频率 ,并与大肠杆菌和哺乳动物进行了比较 ,结果表明三者间的密码子偏爱性有较大差异 .这一分析结果对于动物基因在植物中的表达 ,及植物基因在微生物中的表达具有一定指导意义 .同时提供了一种直接以XML文档为数据源解析巨型XML格式染色体数据的方法
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共 1 条
  • [1] XML, bioinformatics and data integration .2 Vaysseix G,Barillot E. Bioinformatics . 2001