一起引发脑膜炎流行的ECHO病毒的序列分析

目的　测定山东省招远县 1987年 2～ 8月发生的无菌性脑膜炎大流行的病因病毒之W株病毒 (Zhaoyuan W 87)的部分序列 ,分析其与其他肠道病毒的关系。方法　病毒用酚 氯仿抽提RNA ,经逆转录合成cDNA ,经聚合酶链反应 (PCR)扩增 ,产物纯化 ,采用双脱氧链末端终止法在ABI377自动核酸测序仪上测定序列。结果　W株 5′端非编码区、2C区和 3D区的部分序列长度分别为 2 44、2 75和 35 3个核苷酸 ;VP1区全基因为 876个核苷酸 ,编码 2 92个氨基酸 ,与检索到的 2株ECHO2 9核苷酸序列的同源性分别为 82 1%和 81 7% ,氨基酸序列的同源性分别为 95 1%和 94 4% ;与检索到的 1株ECHO2核苷酸序列的同源性为 6 2 3%。种系发生树分析 ,W株在单独的一个分支上 ,与 2株ECHO2 9所在分支较近 ,与ECHO2所在分支较远。结论　目前无法判定W株与ECHO2的关系 ,但可以说W株是ECHO2 9的变异味