一种土壤微生物总DNA的高效提取方法

被引:59
作者
黄婷婷
曹慧
王兴祥
崔中利
机构
[1] 南京农业大学农业部环境微生物工程重点开放实验室,南京农业大学农业部环境微生物工程重点开放实验室,中国科学院南京土壤研究所,南京农业大学农业部环境微生物工程重点开放实验室 南京,南京,南京,南京
[2] 中国科学院南京土壤研究所南京
基金
中国博士后科学基金;
关键词
土壤微生物; 总DNA提取; 细胞回收; 粗DNA纯化;
D O I
10.13758/j.cnki.tr.2004.06.015
中图分类号
S154 [土壤生物学];
学科分类号
090301 [土壤学];
摘要
获得高浓度、大片段、多样性程度高的土壤微生物总DNA 是研究土壤微生物群落结构的分子生态学基础。本文采用间接法(菌体细胞回收法)提取红壤地区两种土壤类型的土壤微生物总DNA,定量计算其回收率,并与直接法(细胞原位裂解法)比较了提取效率和纯度。结果表明:红壤地区2种土壤每克干土的总DNA提取量,间接法约为0.34和0.53礸/g干土,直接法约为13.62和24.32礸/g干土;间接法的提取效率低于直接法,但所得DNA片段较大,且Sau 3AⅠ 酶切和16 S rDNA通用引物PCR扩增结果显示,间接法比直接法更能有效地去除土壤中的某些抑制剂,所得总DNA的纯度更高,有利于后续操作。
引用
收藏
页码:662 / 666
页数:5
相关论文
共 7 条
[1]
重金属复合污染农田土壤DNA的快速提取及其PCR-DGGE分析 [J].
滕应 ;
骆永明 ;
赵祥伟 ;
李振高 ;
宋静 ;
吴龙华 .
土壤学报, 2004, (03) :343-347
[2]
土壤微生物多样性研究的新方法 [J].
马万里 ;
Josquin Tibbits ;
Mark Adams .
土壤学报, 2004, (01) :103-107
[3]
土壤微生物总DNA的提取和纯化 [J].
张瑞福 ;
曹慧 ;
崔中利 ;
李顺鹏 ;
樊奔 .
微生物学报, 2003, (02) :276-282
[4]
红壤生态系统下芽孢杆菌的物种多样性 [J].
张华勇 ;
李振高 ;
王俊华 ;
潘映华 .
土壤, 2003, (01) :45-47
[5]
土壤微生物群落结构的化学估价方法 [J].
白清云 .
农业环境保护, 1997, (06)
[6]
植物总DNA和核DNA提取及其纯度的研究 [J].
徐德昌 ;
赵亚华 ;
杜天奎 .
宁夏农学院学报, 1997, (03) :57-61
[7]
分子克隆实验指南.[M].(美)J.萨姆布鲁克(J.Sambrook)等著;金冬雁等译;.科学出版社.1992,