昆明地区麻疹野病毒株基因型检测

被引：2

作者：

尚晓丽 ^{[1
]}

夏晓玲 ^{[1
]}

侯宗柳 ^{[2
]}

杜曾庆 ^{[3
]}

机构：

[1] 昆明医学院第二附属医院

[2] 昆明市延安医院

[3] 昆明市儿童医院

来源：

生物医学工程与临床 | 2012年 / 16卷 / 02期

关键词：

麻疹病毒; 基因型; 昆明; 序列分析; 野病毒株;

D O I：

10.13339/j.cnki.sglc.2012.02.019

中图分类号：

R725.1 [小儿传染病];

学科分类号：

摘要：

目的检测昆明地区麻疹病毒的优势基因型,为麻疹监测和防治提供依据。方法采集2008年昆明地区临床诊断为麻疹的30例患儿,其中男性18例,女性12例;年龄51天～3岁,0～1岁(≤1岁)的患儿19例,1～2岁(≤2岁)的患儿9例,2～3岁(≤3岁)的患儿2例,平均患病年龄15个月。采集急性传染期静脉血2 mL,应用酶联免疫吸附分析(ELISA)检测麻疹病毒血清IgM抗体;同时收集患儿的尿液标本,运用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增标本中所分离到的麻疹野病毒株核蛋白(N)基因羧基末端的543个核苷酸,对扩增产物进行核苷酸序列测定和分析,并与麻疹病毒基因库中的参考株进行比较。结果从30份麻疹患儿尿液标本中分离到7份麻疹野病毒阳性;出疹后6 d的尿液标本中仍可检出麻疹野病毒;将其4株麻疹野病毒的核蛋白(N)羧基末端的543个核苷酸与Genebank中的麻疹病毒的23个参考株进行基因亲缘性关系比较,与世界卫生组织(WHO)的H1、H2基因型参考株China 93-7、China 94-1所对应的核苷酸序列的遗传距离分别为0.031～0.047和0.332～0.398;而与H1a的遗传距离最近,为0.010～0.033;4株麻疹野病毒N基因羧基末端543个核苷酸的同源性为96.0%～98.9%;与H1标准株China 93-7和H1a标准株China 93-2的核苷酸同源性分别为95.9%～99.7%和96.9%～99.8%。结论2008年昆明地区所检测到的麻疹野病毒的优势基因型为H1a基因型。

引用

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页数：5

共 9 条

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