SARS病毒基因组所编码的E蛋白的二级结构和B细胞表位预测

被引:48
作者
吕燕波
万瑛
吴玉章
机构
[1] 第三军医大学免疫学教研室全军免疫研究所
[2] 第三军医大学免疫学教研室全军免疫研究所 重庆
[3] 重庆
关键词
SARS病毒; E蛋白; B细胞表位; 二级结构; 预测;
D O I
10.13431/j.cnki.immunol.j.20030118
中图分类号
R346 [];
学科分类号
1001 ;
摘要
目的 预测SARS病毒E蛋白的B细胞表位和二级结构。方法 以SARS病毒基因组序列为基础 ,采用Gar nier Robson方法、Chou Fasman方法和Karplus Schultz方法预测E蛋白质的二级结构 ;用Kyte Doolittle方案预测蛋白质的亲水性 ;用Emini方案预测蛋白质的表面可能性 ;用Jameson Wolf方案预测氨基酸的抗原性指数。综合评判 ,预测SARS病毒E蛋白的B细胞表位。结果 在SARS病毒E蛋白N 端的第 1~ 6、13~ 19、39~ 4 3、4 7~ 6 4区段和第 73~ 76区段有 β 折叠中心 ;第 6~ 12区段和第 6 7~ 6 9区段可能形成转角或无规则卷曲 ,是柔性区域。E蛋白N端第 2~ 13区段和第 6 1~ 74区段为B细胞优势表位区域。结论 用多参数预测SARS病毒E蛋白的二级结构和B细胞表位 ,为实验方法探索SARS冠状病毒E蛋白的B细胞表位提供理论依据
引用
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共 2 条
[1]   人DAO氨基酸序列片段B-细胞表位的多参数预测 [J].
陈兴 ;
王更银 ;
丛爱丽 ;
张立 ;
许素菊 .
免疫学杂志, 2000, (03) :232-234
[2]  
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