嗜酸氧化亚铁硫杆菌亚铁氧化酶基因分子多态性研究

被引：8

作者：

杨宇

彭宏

孙斌

王杰伟

胡岳华

机构：

[1] 中南大学资源加工与生物工程学院,中南大学资源加工与生物工程学院,中南大学资源加工与生物工程学院,中南大学资源加工与生物工程学院,中南大学资源加工与生物工程学院长沙,长沙,长沙,长沙,长沙

来源：

遗传 | 2005年 / 05期

基金：

国家创新研究群体科学基金;

关键词：

嗜酸氧化亚铁硫杆菌; 亚铁氧化酶基因; 分子多态性;

D O I：

10.16288/j.yczz.2005.05.020

中图分类号：

Q933 [微生物遗传学];

学科分类号：

071007 ;

摘要：

嗜酸氧化亚铁硫杆菌（Acidithiobacillus ferrooxidans,A.f）属于化能自养、革兰氏阴性细菌,好氧嗜酸,以氧化亚铁离子或还原态硫化物（S0&S2-）获得能量生长。在其Fe2+氧化系统中,亚铁氧化酶起重要作用。对不同硫化矿区分离得到的5株A.f进行生长动力学和对亚铁氧化活性的对比研究,结果显示不同菌株之间存在表型差异。提取A.f菌株的基因组DNA,设计引物,对亚铁氧化酶基因进行PCR扩增,同时对扩增产物直接进行测序,并同GenBank的参考序列进行比对分析,发现序列相似性在99%97%之间,分析编码区域发现在第187～195位可能存在一个高变异区:在第187～189位,菌株YTW编码的氨基酸Thr→Pro;而在第193～195位,菌株TK是Met→Asn;菌株BY则是Met→Ile。另外在位点第219位,所有菌株都是T→C,但编码的氨基酸未发生变化,属于同义密码子。对于编码区上游序列,比对后没有差异;而对于编码区下游序列,经比对发现存在一些差异位点。

引用

页码：787 / 791

页数：5

共 12 条

[1] 用RAPD分子标志方法研究氧化亚铁硫杆菌遗传多样性 [J].

贺治国 ;

胡岳华 ;

胡维新 ;

钟慧 ;

徐兢 ;

朱敏 .

遗传, 2004, (01) :69-74

[2] 氧化亚铁硫杆菌及其在环境工程中的应用 [J].

田翱宇 ;

陈吉春 .

环境技术, 2003, (04) :16-18

[3]

Rusticyanin gene expression of Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 33020 in sulfur- and in ferrous iron media.[J].A Yarzábal;K Duquesne;V Bonnefoy.Hydrometallurgy.2003, 1

[4] Bioleaching of copper ore flotation concentrates [J].

Sadowski, Z ;

Jazdzyk, E ;

Karas, H .

MINERALS ENGINEERING, 2003, 16 (01) :51-53

[5] Crystal structures of the Met148Leu and Ser86Asp mutants of rusticyanin from Thiobacillus ferrooxidans:: Insights into the structural relationship with the cupredoxins and the multi copper proteins [J].

Kanbi, LD ;

Antonyuk, S ;

Hough, MA ;

Hall, JF ;

Dodd, FE ;

Hasnain, SS .

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, 2002, 320 (02) :263-275

[6] Bacterial removal of sulphur from three different coals [J].

Acharya, C ;

Kar, RN ;

Sukla, LB .

FUEL, 2001, 80 (15) :2207-2216

[7]

The molecular genetics of Thiobacillus ferrooxidans and other mesophilic; acidophilic; chemolithotrophic; iron- or sulfur-oxidizing bacteria.[J].Douglas E. Rawlings.Hydrometallurgy.2001, 2

[8]

Mechanisms of bioleaching of a refractory mineral of gold with Thiobacillus ferrooxidans.[J].David Nestor;Urquizo Valdivia;Arthur Pinto Chaves.International Journal of Mineral Processing.2001, 1

[9] Phenotypic characteristics of Thiobacillus ferrooxidans strains [J].

Ageeva, SN ;

Kondrat'eva, TF ;

Karavaiko, GI .

MICROBIOLOGY, 2001, 70 (02) :186-194

[10] The structural gene for rusticyanin from Thiobacillus ferrooxidans: Cloning and sequencing of the rusticyanin gene [J].

Hall, JF ;

Hasnain, SS ;

Ingledew, WJ .

FEMS MICROBIOLOGY LETTERS, 1996, 137 (01) :85-89

← 1 2 →