十字花科植物CYP86MF同源基因的克隆及特征分析

被引:5
作者
王玲平
曹家树
叶纨芝
向珣
余小林
机构
[1] 浙江大学蔬菜研究所
[2] 浙江大学蔬菜研究所 杭州
[3] 浙江省农科院蔬菜研究所
[4] 杭州
关键词
CYP86MF; 同源基因; 特征分析; 大白菜; 萝卜; 诸葛菜;
D O I
暂无
中图分类号
Q943.2 [植物基因工程];
学科分类号
071007 ; 090102 ;
摘要
用保守的特异引物进行PCR扩增,并结合RACE技术,从大白菜(BrassicacampestrisL.)品种黄芽14,萝卜(RaphanussativusL.)品种圆白和诸葛菜(Orychophrogmusviolaceus)3个材料中扩增到3个完整的cDNA全长,分别命名为Bc-CYP86MF,RsCYP86MF和OvCYP86MF,它们的cDNA全长分别为1854,1818和1876bp,分别编码524,526和534个氨基酸残基。将所推导的氨基酸序列与数据库中已知基因进行排序,发现它们与拟南芥CYP86家族所有成员的氨基酸相似性都大于38%,可将它们归为细胞色素CYP86基因家族。BcCYP86MF和RsCYP86MF与CYP86C4亚家族氨基酸同源性均大于55%,则可归为CYP86C4亚家族,而OvCYP86MF与CYP86C3的同源性最高,为86.5%,应归为CYP86C3亚家族。根据氨基酸序列的排序结果构建的系统树表明,CYP450基因的氨基酸序列进化程度与物种的亲缘关系的远近相吻合。对蛋白二级结构预测结果发现,它们都具有细胞色素P450典型的保守结构域FNAGPRLCIG,而且氨基酸组成也很相似。
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共 1 条
[1]   Measurement of Some Physiological and Biochemical Indexes of the Antisense Fragment of CYP86MF Gene Transgenic Male Sterile Plantlets in Chinese Cabbage-Pak-Choi [J].
YU Xiaolin CAO Jiashu and DONG DekunInstitute of Vegetable Science Zhejiang University Hangzhou P R China .
AgriculturalSciencesinChina, 2003, (11) :64-70