T-RFLP技术在人肠道柔嫩梭菌类群的组成分析中的应用

被引:2
作者
柳欣源
申剑
王婷婷
李旻
赵立平
庞小燕
机构
[1] 上海交通大学生命科学技术学院微生物分子生态与生态基因组学实验室
关键词
T-RFLP; 柔嫩梭菌类群; 多样性;
D O I
10.13381/j.cnki.cjm.2009.08.015
中图分类号
R378 [病原细菌];
学科分类号
100103 ; 100705 ;
摘要
目的建立能快速筛查和比较大规模人群肠道中柔嫩梭菌类群组成结构的T-RFLP(末端限制性片段长度多态性)。方法采用T-RFLP技术特异性地分析柔嫩梭菌类群的组成,考察该方法的重复性和灵敏度。用该方法对15个志愿者肠道中的柔嫩梭菌类群进行分析,并与DGGE方法分析的结果进行对比。结果T-RFLP方法重复性高,最低能检测到群落中1%的细菌,其结果与DGGE的分析结果具有较好的一致性。结论本研究建立的柔嫩梭菌类群特异性的T-RFLP方法能够对大量肠道样品中柔嫩梭菌类群的结构进行快速、有效的筛查和比较。
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共 1 条
[1]  
Use of 16S rRNA gene-targeted group-specific primers for real-time PCR analysis of predominant bacteria in human feces. Matsuki T, K Watanabe, J Fujimoto, et al. Applied and Environmental Microbiology . 2004