龙胆属6种药用植物的ITS2序列分析

被引:4
作者
王秋霞
孙海
魏云洁
张舒娜
杨振
张亚玉
机构
[1] 中国农业科学院特产研究所
关键词
龙胆属; ITS2序列; 药用植物; 亲缘关系分析;
D O I
10.16720/j.cnki.tcyj.2015.03.006
中图分类号
S567 [药用作物];
学科分类号
090104 [作物信息科学与技术];
摘要
本试验采用ITS2序列进行龙胆属6种药用植物的亲缘关系分析。通过测定粗糙龙胆(Gentiana scabra)、三花龙胆(G.triflora)和条叶龙胆(G.manshurica)的ITS2序列,同时从Gen Bank下载包括滇龙胆(G.rigescens)、秦艽(G.macrophylla)和麻花艽(G.straminea)3种药用植物在内的27个样本ITS2序列,采用Clustal X、Gene Doc和MEGA 5.0软件比较分析龙胆属6种药用植物的ITS2序列特征,进而用MP、ML和NJ法分别构建了龙胆属植物的分子进化树。结果显示,龙胆属6种药用植物(包括粗糙龙胆、三花龙胆、条叶龙胆、滇龙胆、秦艽和麻花艽)的ITS2序列共有187个保守位点和39个变异位点,粗糙龙胆、三花龙胆、条叶龙胆、滇龙胆的ITS2序列GC含量较高,分别为60.2%、60.6%、60.6%和60.0%;而秦艽和麻花艽的GC含量较低,分别为58.2%和56.3%。龙胆属6种药用植物中粗糙龙胆、三花龙胆和条叶龙胆3个物种间遗传距离较近,尤其是粗糙龙胆和条叶龙胆之间仅为0.005;滇龙胆和麻花艽间的遗传距离最远(0.117)。亲缘关系分析显示,龙胆草组物种(粗糙龙胆、三花龙胆和条叶龙胆)和秦艽组物种(秦艽、麻花艽)表现出更近的亲缘关系;滇龙胆和其他5种药用植物(粗糙龙胆、三花龙胆、条叶龙胆、滇龙胆、秦艽和麻花艽)间的亲缘关系则较远。ITS2序列可以作为进行龙胆属6种药用植物亲缘关系分析的依据。
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[1]
DNA分子标记技术在龙胆鉴别与亲缘关系划分上的应用 [J].
曹秀明 ;
郑蔚虹 ;
尚明 .
中华中医药学刊 , 2007, (04) :829-830
[2]
Comparative analysis among three Taiwan-specific Gentiana species and Chinese medicinal plant Gentiana scabra.[J].Shih-Hung Huang;Emily Chin-Fun Chen;Chin-Tung Wu;Chao-Lin Kuo;Hsin-Sheng Tsay.Botanical Studies.2013, 1
[3]
Genetic diversity and gentiopicroside content of four Gentiana species in China revealed by ISSR and HPLC methods.[J].Peng Zheng;Kejin Zhang;Zhezhi Wang.Biochemical Systematics and Ecology.2011, 4
[4]
Identification of medicinal plants in the family Fabaceae using a potential DNA barcode ITS2 [J].
Gao, Ting ;
Yao, Hui ;
Song, Jingyuan ;
Liu, Chang ;
Zhu, Yingjie ;
Ma, Xinye ;
Pang, Xiaohui ;
Xu, Hongxi ;
Chen, Shilin .
JOURNAL OF ETHNOPHARMACOLOGY, 2010, 130 (01) :116-121
[5]
Phylogenetic use of noncoding regions in the genus Gentiana L: Chloroplast trnL (UAA) intron versus nuclear ribosomal internal transcribed spacer sequences [J].
Gielly, L ;
Yuan, YM ;
Kupfer, P ;
Taberlet, P .
MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION, 1996, 5 (03) :460-466
[6]
中华人民共和国药典.[M].国家药典委员会; 编译.中国医药科技出版社.2011,
[7]
植物基因工程.[M].王关林;方宏筠主编;.科学出版社.2002,