对虾白斑综合症病毒重组cDNA克隆的构建与分析

取经人工注射感染了对虾白斑综合症病毒 40— 45h的凡纳对虾鳃组织 ,分离mRNA ,以mRNA为模板合成双链cDNA ,并克隆于PUC质粒的NotI/SalI位点 ,构建了 1 0 0 0余株对虾感染后期鳃细胞的重组cDNA克隆。重组质粒经PCR鉴定插入片段 ,DNA斑点杂交分析目的片段 ,测定了 2 0株对虾白斑综合症病毒的重组cDNA克隆的末端DNA序列 ,并对其进行了包含存在的开放阅读框架、启动区上游序列、编码产物的特性等分析。结果显示 :PCR产物在0 3— 1 6kb之间 ;大于 1kb的克隆中有 31 8%的克隆为白斑综合症病毒的重组cDNA克隆。已测序的不包含同源序列的 1 3株克隆中含有 1 4个开放阅读框 ,其中 1 1个上游可检出启动子基序 ,4个可检出启动子调制元件。ORF转译产物的特性基序分析显示 :有 2个ORFs可检出锌指基序 ,3个ORFs可检出亮氨酸拉链基序 ,2个ORFs可检出NTP结合基序 ,未检出核定位信号基序。