ERIC-PCR:一种快速鉴别环境细菌菌株的方法

被引：8

作者：

赵立平

肖虹

李艳琴

张峰

不详

机构：

[1] 山西大学生物技术研究所!太原

来源：

应用与环境生物学报 | 1999年 / S1期

关键词：

ERIC-PCR; 细菌; DNA指纹图;

D O I：

暂无

中图分类号：

Q939.110.9X172 * [];

学科分类号：

071005 ; 100705 ;

摘要：

以ＥＲＩＣ（肠杆菌基因间共有重多序列）序列设计的特异引物对３株大肠杆菌、３株软腐欧氏杆菌、２株草生欧氏杆菌、１株梨火疫欧氏杆菌、１株催娩克氏菌、１株阴沟肠杆菌和９株具有降酚能力的细菌等２０种细菌的基因组ＤＮＡ进行ＰＣＲ分析．每种菌株均存在数目不等的各自独特的带型，能够区分同一种类中极为相近的菌株．经多次重复，各特异性扩增的主要带型能重复稳定出现．聚类分析的结果表明，供试菌株多数按照分类地位归到相应的组中．９种具有降酚能力的细菌中，２种分离自处理焦化废水池活性污泥，７种来自土壤样品．ＥＲＩＣＰＣＲ指纹图显示，前２种属于一类，都有一条大小约１．１ｋｂ的主带，其它７种土壤中分离出来的细菌除其中１种有１条约１．２ｋｂ大小的主带外，其余６种都有１条大小约１．４ｋｂ的带．聚类分析将从土壤中分离出来的细菌归为３种不同的类型．ＥＲＩＣＰＣＲ可以从分子水平对细菌基因组进行快速指纹图分析，在对环境细菌分离物进行快速鉴定和归类等方面具有实用价值

引用

页码：30 / 33

页数：4

共 5 条

[1]

Use ofrepetitive (repetitive extragenic palindromic and enterobacterial repetitive intergeneric consensus) sequences andthe polymerase chain reaction tofingerprintthe genomes of Rhizobium melilotiisolates and other soil bacteria. de Bruijin R J. Applied and Environmental Microbiology . 1992

[2]

Sharp P M E R I Csequences:a novelfamily ofrepetitive elementsin the genomes of Escherichia coli, Salmonella typhimurium and other enterobacteria. Hulton C S J,Higgins C F. Molecular Microbiology . 1991

[3]

Astatistical method for evaluating systematic relationships. Sokal R R,Michener C D. Univ Kansas Sci Bull . 1958

[4]

Distribution of repetitive D N Asequences in eubacteria and application to fingprinting of bacterialgenomes. Versalovic J,Koeuth T,Lupski J R. Nucleic Acids Research . 1991

[5]

Use ofrepetitive sequencesandthe polymerase chain reaction techniqueto classifygenetically related Bradyrhizobium japonicum serocluster 123 strains. Judd A K,Schneider M,Sadowsky M J,de Bruun F J. Appl. Environ . Microbiol . 1993

← 1 →