目的了解不同地区临床分离铜绿假单胞菌耐药基因的流行现状。方法对临床分离的104株铜绿假单胞菌采用ATB细菌鉴定仪鉴定菌种和K-B法测定抗菌药物的敏感性,利用聚合酶链反应(PCR)检测耐药基因(16种)和多分子标志法聚类分析菌株的亲缘性。结果3个地区铜绿假单胞菌对亚胺培南的耐药率依次为51.3%、80.0%和100.0%,对第三代头孢菌素的耐药率为48.2%100.0%,耐药基因oprD2缺失率为90%100%;多重耐药基因标志的菌株显示存在克隆传播现象,但绍兴地区流行耐药株以oprD2的缺失为主,湖州地区则以TEM、oprD2缺失、aac(3)-Ⅱ、ant(3″)-Ⅰ、qacE△1为主。结论3个地区临床分离的铜绿假单胞菌呈多重耐药,并由克隆传播导致医院感染,但耐药的机制并不相同。