2009年上海地区甲型流行性感冒流行及甲型H1N1病毒分离株变异分析

被引:4
作者
吕锡宏 [1 ]
谈逸云 [2 ]
居丽雯 [1 ]
申惠国 [2 ]
高颖阳 [1 ]
熊海燕 [1 ]
姜庆五 [1 ]
机构
[1] 复旦大学公共卫生学院流行病学教研室 公共卫生安全教育部重点实验室
[2] 上海市闵行区疾病预防控制中心
基金
国家高技术研究发展计划(863计划);
关键词
流感病毒A型,H1N1亚型; 流感,人,上海; 变异(遗传学); 基因,病毒;
D O I
暂无
中图分类号
R51 [传染病];
学科分类号
100401 ;
摘要
目的了解2009年上海地区人群流行性感冒(流感)的流行特征和流行期间甲型H1N1分离株基因和抗原的变异。方法采集2009年上海地区哨点医院和学校聚集性流感样患者咽拭子标本,接种犬肾细胞(MDCK细胞)分离流感病毒,直接荧光免疫法鉴定流感病毒型,RT-PCR法鉴定亚型,对部分甲型H1N1流感病毒进行血凝素(HA)、神经氨酸酶(NA)等片段全基因测序,分析甲型H1N1流感病毒HA、NA等基因变异。结果 2009年上海地区冬春季人群流感中,季节性H1N1和H3N2流感同时存在,进入第32周时,甲型H1N1和季节性H3N2流感同时流行,第40周后主要是甲型H1N1流行。甲型H1N1流行株HA进化分析显示,不同区域、不同月份分离株互有穿插,上海地区分离株聚集成簇形成一个分枝,与西班牙、俄罗斯、丹麦等国的流行株接近。HA演绎推导氨基酸位点虽有变异,但都不位于抗原决定区域;NA基因演绎推导氨基酸位点未观察到274位点及与耐奥司他韦药物相关其他位点的变异;PB2蛋白氨基酸序列分析显示,第627位和第701位氨基酸分别是谷氨酸和天冬氨酸,为禽源流感病毒PB2蛋白氨基酸位点。结论 2009年上海地区冬春季人群流感,季节性H1N1和H3N2同时流行,夏秋季开始甲型H1N1、季节性H3N2在人群中同时流行,之后以甲型H1N1为主。甲型H1N1与早期分离株比较有一定变异,但尚未出现流行病学意义的抗原漂移株,仍表现为对人的高亲和力和低致病性特征。
引用
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共 5 条
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