西藏扎布耶茶卡盐碱湖古菌多样性的非培养技术分析

被引:15
作者
范华鹏
薛燕芬
曾艳
周培瑾
马延和
机构
[1] 中国科学院微生物研究所
关键词
盐碱湖; 古菌多样性; 非培养技术;
D O I
10.13343/j.cnki.wsxb.2003.04.001
中图分类号
Q93-3 [微生物研究与微生物实验];
学科分类号
摘要
采用非培养技术 ,直接从西藏扎布耶茶卡盐碱湖样品中提取微生物总DNA。以样品总DNA为模板 ,PCR扩增湖中古菌的 1 6SrDNA序列。扩增产物经过克隆并随机挑选 60个克隆进行测序得到它们的 1 6SrDNA部分序列 ,大部分序列与嗜盐碱古菌的 1 6SrDNA相近。在系统发育树上 ,部分克隆与已知古菌属归于同一分支 ,主要分布在嗜盐菌科的Natronococcus、Natronorubrum、Natronobacterium、Natronomonas、Natrinema、Halorubrum、Haloterrigena和Halorhabdus等 8个嗜盐古菌属中 ,也有一些克隆形成了独立的分支。它们共同显示出扎布耶茶卡湖中的古菌具有丰富的多样性。
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共 4 条
[1]  
Microbial diversity at 83°C in Calcite Springs, Yellowstone National Park: another environment where the Aquificales and "Korarchaeota" coexist[J] . A.-L. Reysenbach,M. Ehringer,K. Hershberger.Extremophiles . 2000 (1)
[2]   Novel archaeal phylotypes from an East African alkaline saltern [J].
Grant, S ;
Grant, WD ;
Jones, BE ;
Kato, C ;
Li, L .
EXTREMOPHILES, 1999, 3 (02) :139-145
[3]   Molecular analyses of the sediment of the 11000-m deep Mariana Trench [J].
Kato, C ;
Li, LN ;
Tamaoka, J ;
Horikoshi, K .
EXTREMOPHILES, 1997, 1 (03) :117-123
[4]  
Description of prokaryotic biodiversity along the salinity gradient of a multipond solar saltern by direct PCR amplification of 16S rDNA[J] . Susana Benlloch,Silvia G. Acinas,A. J. Martínez-Murcia,Francisco Rodríguez-Valera.Hydrobiologia . 1996 (1)