黄海蓝点马鲛mtDNA D-loop序列变异分析

被引:18
作者
姜艳艳
孔晓瑜
喻子牛
庄志猛
金显仕
机构
[1] 中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室
[2] 农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室
[3] 农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室 山东 青岛 农业部海洋渔业资源可持续利用重点开放实验室
[4] 中国水产科学研究院
[5] 黄海水产研究所
[6] 山东 青岛
[7] 山东 青岛
关键词
蓝点马鲛; mtDNA; D-loop; 遗传多样性;
D O I
暂无
中图分类号
S917 [水产生物学];
学科分类号
摘要
采用聚合酶链式反应(PCR)技术对山东半岛南岸水域的蓝点马鲛(Scomberomorus niphonius)群体(n=20)的mtDNA D-loop序列进行扩增,获得了大小约为500 bp的扩增产物。PCR产物经纯化后进行序列测定,得到了410bp的核苷酸片段(除去引物及部分端部序列)。用Genedoc软件进行排序比较,在这20个个体中,共检测到54个变异位点,包括2个碱基缺失、1个碱基插入、43个转换位点、7个颠换位点及2个转换与颠换同时存在的位点。运用MEGA软件计算出不同个体间的遗传距离,并据此构建了UPGMA和NJ系统树。用DNASP软件计算出的多态位点数(S)为54、核苷酸多样性(Pi)和平均核苷酸差异数(K)分别为0.0271和11.047。研究结果表明,蓝点马鲛的mtDNA D-loop基因个体变异程度较大,适合于群体内及群体间不同个体的遗传多样性分析。
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