村"两委"与村集体经济组织的"政经关系"一直是困扰我国基层治理的重大问题。通过广东南海"政经分离"、江苏枫桥"政经分开"、浙江温州"三分三改"三种模式的比较分析,发现以"政经分开"促进农村基层治理转型创新实践的典型,具有较强"可复制性"。在农村社会经历着历史性大变革的新时期,唯有通过改革打破僵化的体制机制,尽快使成熟的经验和模式上升到制度层面并纳入法制轨道,明确党组织、村委会和集体经济组织的职能定位及其相互关系,继而完善基层治理结构,并构建新型农村基层治理框架,才能尽快实现农村基层治理转型与现代化。